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J-GLOBAL ID：201902219521883145   整理番号：19A0972829

メタゲノム解析は土壌水分,硝酸塩勾配にわたる脱窒遺伝子量の異なるパターンを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Metagenomic analysis reveals distinct patterns of denitrification gene abundance across soil moisture, nitrate gradients

著者 (7件)： Nadeau Sarah A. (Department of Biological & Environmental Engineering, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Roco Constance A. (Department of Microbiology, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Debenport Spencer J. (Soil and Crop Sciences Section, School of Integrative Plant Science, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Anderson Todd R. (Division of Natural Sciences and Mathematics, Keuka College, Keuka Park, NY, USA) ,  Hofmeister Kathryn L. (Department of Natural Resources, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Walter M. Todd (Department of Biological & Environmental Engineering, Cornell University, Ithaca, NY, USA) ,  Shapleigh James P. (Department of Microbiology, Cornell University, Ithaca, NY, USA)
資料名： Environmental Microbiology  (Environmental Microbiology)
巻： 21  号： 4  ページ： 1255-1266  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2561A  ISSN： 1462-2912  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究は,環境因子が異なる脱窒活性を示す異なる脱窒コミュニティをどのようにしているかを示すために,土壌中の脱窒遺伝子豊度の景観スケールのメタゲノム調査とin situ脱窒測定を結びつけた。水文学的勾配を横切って,メタゲノムの読み出し豊度から推定された全脱窒素遺伝子(nap/nar+nirK/nirS+cNor,qNor+nosZ)の分布は一貫したパターンを示さなかった。しかし,遺伝子が独立に考えられた場合,nirS,cNorおよびnosZの読み出し豊度は,より高い土壌水分,より高い硝酸塩およびより高い年間脱窒素速度の地域と正に関連していたが,nirKおよびqNorの読み取り量はこれらの因子と負に関連していた。これらの結果は,環境条件,特に土壌水分と硝酸塩が明らかに機能的に冗長な蛋白質をコードする遺伝子の異なる豊度によって特徴付けられる異なる脱窒群集を選択することを示唆する。対照的に,分類学的分析は,サイトを横切る脱窒群集組成における顕著な変動性を同定しなかった。脱窒に対する能力はサイトを横切って普遍的であったが,nirSやcNorのようなより高いエネルギーコストを持つ脱窒遺伝子は,より頻繁な土壌飽和とより大きな硝酸塩投入を経験する微生物群集において選択的利点を与えるように見えた。本研究は,メタゲノミクスが非点源窒素汚染を処理するために保護または強化され得る脱窒ホットスポットの同定を助けることができることを示唆する。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *土壌水 ,  *コピー数 ,  コミュニティ ,  冗長性 ,  *硝酸塩 ,  *遺伝子 ,  *脱窒 ,  タンパク質
準シソーラス用語： 微生物コンソーシアム ,  群集構造 ,  分類学 ,  環境条件 ,  *メタゲノム ,  環境因子 ,  *メタゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 土壌生物  (FB04050N) ,  下水,廃水の生物学的処理  (SC03060H)

タイトルに関連する用語 (6件)： メタゲノム解析 ,  土壌水分 ,  硝酸塩 ,  勾配 ,  脱窒 ,  遺伝子量