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J-GLOBAL ID：201902220445168122   整理番号：19A0985950

ポリ-グリシン-アラニン(ポリ-Gaの構造,折畳みおよび凝集の分子動力学研究【JST・京大機械翻訳】

Molecular dynamics study of structure, folding, and aggregation of poly-glycine-alanine (Poly-GA)

著者 (4件)： Zheng Size (College of Materials and Chemistry and Chemical Engineering, Chengdu University of Technology, Chengdu, Sichuan 610059, People’s Republic of China) ,  Sahimi Ali (Department of Stem Cell Biology and Regenerative Medicine, University of Southern California, Los Angeles, California 90033-1425, USA) ,  Shing Katherine S. (Mork Family Department of Chemical Engineering and Materials Science, University of Southern California, Los Angeles, California 90089-1211, USA) ,  Sahimi Muhammad (Mork Family Department of Chemical Engineering and Materials Science, University of Southern California, Los Angeles, California 90089-1211, USA)
資料名： Journal of Chemical Physics  (Journal of Chemical Physics)
巻： 150  号： 14  ページ： 144307-144307-12  発行年： 2019年 
JST資料番号： C0275A  ISSN： 0021-9606  CODEN： JCPSA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ポリ-グリシン-アラニン(ポリ-Ga蛋白質は,筋萎縮性側索硬化症(ALS)および前頭側頭葉性認知症に関連する主要な毒性ジペプチド反復分子の1つであると広く信じられている。不連続分子動力学シミュレーション及び蛋白質の全原子モデルを用いて,ポリGAの折畳み,安定性及び凝集を研究した。結果は,ポリGAが十分長い時間後に,最近の実験データに適合するβシートに富む凝集体を形成し,2つのユニークな螺旋構造が非常に頻繁に形成されることを示した。二つの構造の詳細を解析した。解析は,このような螺旋構造が安定で,αヘリックスとβシートの両方の特性を共有することを示した。分子シミュレーションは,同じ現象がポリ-グリシン-アルギニン(ポリ-GRの凝集でも起こることを示した。したがって,Xが非グリシンアミノ酸とnである可能性のあるタイプ(GX)_nの蛋白質は,βヘリックスと二重螺旋の同じ折畳み構造を共有し,この特性に最も寄与する反復のグリシンであると仮定した。溶媒としての連続相互作用ポテンシャルと明示的水分子による分子動力学シミュレーションは仮説を支持する。著者らの知る限り,これはポリGAとポリGR蛋白質を含む現象の最初の分子動力学シミュレーションである。Copyright 2019 AIP Publishing LLC All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 計算機シミュレーション ,  *分子動力学 ,  *折畳み ,  二重螺旋 ,  凝集体 ,  β構造 ,  ジペプチド ,  折畳み構造 ,  タンパク質 ,  認知症 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸
準シソーラス用語： βヘリックス ,  分子シミュレーション ,  αヘリックス ,  全原子モデル ,  分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： グリシン

タイトルに関連する用語 (6件)： グリシン ,  アラニン ,  Ga ,  凝集 ,  分子動力学 ,  研究