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J-GLOBAL ID：201902220951938225   整理番号：19A2216430

日本から分離されたNDM-5-,CTX-M-14-,OXA-10-およびMCR-1-共生産大腸菌ST167株の全ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Whole-genome analysis of EC129, an NDM-5-, CTX-M-14-, OXA-10- and MCR-1-co-producing Escherichia coli ST167 strain isolated from Japan

著者 (16件)： Nukui Yoko (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Ayibieke Alafate (Department of Molecular Microbiology, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Taniguchi Makoto (Oral Microbiome Center, Kagawa, Japan) ,  Aiso Yoshibumi (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Shibuya Yuka (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Sonobe Kazunari (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Sonobe Kazunari (Department of Clinical Laboratory, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Nakajima Jun (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Nakajima Jun (Department of Clinical Laboratory, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Kanehira Saki (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Kanehira Saki (Department of Clinical Laboratory, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Hadano Yoshiro (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Tohda Shuji (Department of Clinical Laboratory, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Koike Ryuji (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Saito Ryoichi (Department of Infection Control and Prevention, Medical Hospital, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan) ,  Saito Ryoichi (Department of Molecular Microbiology, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan)
資料名： Journal of Global Antimicrobial Resistance  (Journal of Global Antimicrobial Resistance)
巻： 18  ページ： 148-150  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3403A  ISSN： 2213-7165  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： カルバペネム産生腸内細菌科の出現と伝播は世界的な関心事である。本研究は,肺炎と診断された入院患者の痰サンプルから分離されたNDM-5,CTX-M-14,OXA-10およびMCR-1共産生大腸菌配列型167(ST167)多剤耐性臨床株(EC129)の全ゲノム配列を報告する。大腸菌EC129のゲノムを次世代配列決定にかけ,読み取りを組み立てた。ドラフトゲノムをDDBJ Read Ansection Pipeline DFASTサーバを用いて注釈し,続いてin silico解析を行った。大腸菌ST167株EC129のゲノムは,長さが5319159bpであり,5022の蛋白質コード配列を含んでいる。bla_NDM-5,bla_CTX-M-14,bla_OXA-10及びMCR-1遺伝子は,アミノグリコシド,フルオロキノロン,スルホンアミド,トリメトプリム及びテトラサイクリンに対する耐性を付与する他の抗微生物耐性遺伝子と共に検出された。抗微生物感受性試験は,分離株がコリスチン以外のすべての抗菌剤に耐性であることを明らかにした。著者らの知る限りでは,本研究は,日本における肺炎を有する個人の痰試料から分離された非大腸菌ST167株を共生産するNDM-5,CTX-M-14,OXA-10およびMCR-1を初めて報告し,この株の分子特性および耐性遺伝子多様性を明らかにした。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多剤耐性 ,  ニューキノロン系抗細菌薬 ,  抗微生物作用 ,  スルホンアミド ,  *ゲノム ,  肺炎 ,  遺伝子 ,  *大腸菌 ,  窒素複素環化合物 ,  フェノールエーテル
準シソーラス用語： コリスチン ,  分離株 ,  耐性遺伝子 ,  アミノグリコシド ,  ゲノム配列 ,  *全ゲノム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 大腸菌 ,  NDM-5 ,  MCR-1 ,  全ゲノム配列決定

分類 (4件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  微生物生理一般  (EG03051L) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： トリメトプリム

タイトルに関連する用語 (3件)： 日本 ,  大腸菌 ,  全ゲノム解析