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J-GLOBAL ID：201902221020676297   整理番号：19A2282396

MetaによるColon腫瘍間質の転写シグネチャの同定-分析【JST・京大機械翻訳】

Identification of Transcriptional Signatures of Colon Tumor Stroma by a Meta-Analysis

著者 (9件)： Uddin Md. Nazim (Biomedical Informatics Research Lab, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Uddin Md. Nazim ( Cancer Genomics Research Center, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Uddin Md. Nazim ( Big Data Research Institute, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Li Mengyuan (Biomedical Informatics Research Lab, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Li Mengyuan ( Cancer Genomics Research Center, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Li Mengyuan ( Big Data Research Institute, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Wang Xiaosheng (Biomedical Informatics Research Lab, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Wang Xiaosheng ( Cancer Genomics Research Center, School of Basic Medicine and Clinical Pharmacy, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China) ,  Wang Xiaosheng ( Big Data Research Institute, China Pharmaceutical University, Nanjing 211198, China)
資料名： Journal of Oncology (Web)  (Journal of Oncology (Web))
巻： 2019  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7781A  ISSN： 1687-8450  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.腫瘍間質は,腫瘍成長,浸潤および転移に影響を及ぼすことにおいて中心的な役割を果たす。結腸腫瘍間質(CTS)の転写特性は,結腸癌の予後と有意に関連している。したがって,CTS転写特性の同定は結腸癌診断と治療に有用である。方法:3つのCTS遺伝子発現プロファイルデータセットのメタ分析により,CTSと結腸正常間質の間の差次的に発現した遺伝子(DEG)を同定した。さらに,著者らは,DEGと有意に関連する経路,上流調節因子,および蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを同定した。さらに,CTSにおける免疫シグネチャの濃縮レベルを分析した。最後に,結腸癌において発現が有意に予後と関連するCTS関連遺伝子の特徴を同定した。結果.CTHRC1,NFE2L3,SULF1,SOX9,Enc1およびCCND1のような多数の有意に上方制御された遺伝子を同定し,CTS対結腸正常間質において有意に下方制御された遺伝子(MYOT,ASPA,KIAA2022,ARHGEF37,BCL-2およびPPARGC1A)を同定した。さらに,主に細胞発生,免疫調節,および代謝に関与するCTSにおける有意に上方制御された経路と,ほとんど代謝関連のCTSにおける有意に下方制御された経路を同定した。さらに,上流のTF(SUZ12,NFE2L2,RUNX1,STAT3およびSOX2),キナーゼ(MAPK14,CSNK2A1,CDK1,CDK2およびCDK4)を同定し,主代謝転写調節因子(MMTrS)(HNF1A,NFKB1,ZBTB7A,GATA2およびGATA5)を調節した。CD8+T細胞は結腸正常間質よりもCTSにおいてより濃縮されていることを見出した。興味あることに,多くのDEGおよびそれらの調節因子は,CEBPB,PPARGC1,STAT3,MTOR,BCL2,JAK2およびCDK1を含む結腸癌に対する予後マーカーであることを見出した。結論.CTS特異的転写特性の同定は,結腸癌の発生を仲介する腫瘍微小環境への洞察を提供し,結腸癌の診断と治療に対する潜在的な臨床的意味を有する可能性がある。Copyright 2019 Md. Nazim Uddin et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 予後 ,  メタ分析 ,  診断 ,  *間質組織 ,  ネットワーク ,  アップレギュレーション ,  ダウンレギュレーション ,  代謝 ,  結腸腫瘍 ,  結腸 ,  遺伝子
準シソーラス用語： キナーゼ ,  調節因子 ,  遺伝子発現プロファイリング ,  *腫瘍間質 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

引用文献 (60件)：

• K. C. Valkenburg, A. E. de Groot, K. J. Pienta, "Targeting the tumour stroma to improve cancer therapy," Nature Reviews Clinical Oncology, vol. 15, no. 6, pp. 366-381, 2018.
• K. M. Bussard, L. Mutkus, K. Stumpf, C. Gomez-Manzano, F. C. Marini, "Tumor-associated stromal cells as key contributors to the tumor microenvironment," Breast Cancer Research, vol. 18, no. 1, pp. 84, 2016.
• D. Hanahan, L. M. Coussens, "Accessories to the crime: functions of cells recruited to the tumor microenvironment," Cancer Cell, vol. 21, no. 3, pp. 309-322, 2012.
• F. Bray, J. Ferlay, I. Soerjomataram, R. L. Siegel, L. A. Torre, A. Jemal, "Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries," CA: A Cancer Journal for Clinicians, vol. 68, no. 6, pp. 394-424, 2018.
• A. Calon, E. Lonardo, A. Berenguer-Llergo, "Stromal gene expression defines poor-prognosis subtypes in colorectal cancer," Nature Genetics, vol. 47, pp. 320-329, 2015.

タイトルに関連する用語 (5件)： 腫瘍間質 ,  転写 ,  シグネチャ ,  同定 ,  分析