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J-GLOBAL ID：201902221144588881   整理番号：19A0710638

二倍体から異質四倍体へのワタbHLH蛋白質の分岐と進化【JST・京大機械翻訳】

Divergence and evolution of cotton bHLH proteins from diploid to allotetraploid

著者 (11件)： Liu Bingliang (National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cotton Hybrid R & D Engineering Center (the Ministry of Education), Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Liu Bingliang (Institute of Engineering and Technology in Rice Industry, Yangzhou University, Yangzhou, China) ,  Guan Xueying (National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cotton Hybrid R & D Engineering Center (the Ministry of Education), Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Liang Wenhua (Institute of Food Crops, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Jiangsu High Quality Rice R&D Center, Nanjing, China) ,  Chen Jiedan (National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cotton Hybrid R & D Engineering Center (the Ministry of Education), Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Fang Lei (National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cotton Hybrid R & D Engineering Center (the Ministry of Education), Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Hu Yan (National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cotton Hybrid R & D Engineering Center (the Ministry of Education), Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Guo Wangzhen (National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cotton Hybrid R & D Engineering Center (the Ministry of Education), Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Rong Junkang (The Key Laboratory for Quality Improvement of Agricultural Products of Zhejiang Province, School of Agriculture and Food Science, Zhejiang A&F University, Linan, Hangzhou, China) ,  Xu Guohua (MOA Key Laboratory of Plant Nutrition and Fertilization in Lower-Middle Reaches of the Yangtze River, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Zhang Tianzhen (National Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement, Cotton Hybrid R & D Engineering Center (the Ministry of Education), Nanjing Agricultural University, Nanjing, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 162  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 倍数性はゲノム拡大における主要な駆動力と考えられており,その発現が倍数化の結果として保存されている可能性がある重複遺伝子をもたらす。四倍体ワタ(Gossypium hirsutum)とその二つの二倍体前駆細胞,G.arboreumとG.raimondiiのゲノム配列を比較し,bHLH遺伝子が倍数体化により保存されていることを見出した。反対に,ホメオ遺伝子対の発現は多様化した。bHLHファミリーに対するバイアスされたホメオの割合は,ゲノムの広いホメオ発現バイアス(40%)よりも有意に高かった(64.6%)。カカオ(T.cacao)と比較して,オーソログ遺伝子は全ワタbHLHファミリーのわずかな割合(41.7%)を占めた。さらなるKs分析は,bHLH遺伝子が全ゲノム重複の少なくとも2つの異なるエピソードを受けることを示した:最近の重複(1.0~6200万年前,MYA,0.005<Ks<0.312)および古い重複(>60.0MYA,0.312<Ks<3.0)。古い重複イベントはbHLHファミリーの拡大に重要な役割を果たしている可能性がある。最近と古い重複対(68.8%)の両方は,分岐した発現プロファイルを示し,特殊な機能を示した。重複遺伝子の発現多様化は,それがワタの長期進化の普遍的特徴である可能性があることを示唆した。ワタbHLH蛋白質の概観は,二倍体から異質四倍体への保存された分岐進化を示した。著者らの結果は,倍数性の長期進化を研究するための優れた例を提供した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ホメオティック遺伝子 ,  ゲノム ,  *四倍体 ,  多様化 ,  *二倍体 ,  遺伝子重複 ,  バイアス ,  遺伝子
準シソーラス用語： 遺伝子発現プロファイリング ,  エピソード ,  ゲノム配列 ,  オーバーラップ遺伝子 ,  倍数体化 ,  多倍数性 ,  bHLH , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： BHLH蛋白質 ,  オーソロガス遺伝子 ,  重複対 ,  拡張 ,  多様な発現

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  繊維料作物  (FC03077U)

引用文献 (49件)：

• New Phytol; Dating the origins of polyploidy events; JJ Doyle, AN Egan; 186; 1; 2010; 73-85; 10.1111/j.1469-8137.2009.03118.x; citation_id=CR1
• Plant Mol Biol; Genome evolution in polyploids; JF Wendel; 42; 1; 2000; 225-249; 10.1023/A:1006392424384; citation_id=CR2
• Curr Opin Genet Dev; Polyploidy and genome evolution in plants; PS Soltis, DB Marchant, Y Van de Peer, DE Soltis; 35; 2015; 119-125; 10.1016/j.gde.2015.11.003; citation_id=CR3
• Nature; Ancestral polyploidy in seed plants and angiosperms; Y Jiao, NJ Wickett, S Ayyampalayam, AS Chanderbali, L Landherr, PE Ralph, LP Tomsho, Y Hu, H Liang, PS Soltis; 473; 7345; 2011; 97-100; 10.1038/nature09916; citation_id=CR4
• Science; The origins of genomic duplications in Arabidopsis; TJ Vision, DG Brown, SD Tanksley; 290; 5499; 2000; 2114-2117; 10.1126/science.290.5499.2114; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： 二倍体 ,  ワタ ,  bHLH蛋白質 ,  分岐 ,  進化