ワンポット部位マッピングとグリカン分析によるペルメチル化による糖ペプチドの迅速分析のためのツール【JST・京大機械翻訳】

Shajahan Asif; Supekar Nitin T.; Heiss Christian; Ishihara Mayumi; Azadi Parastoo

文献

J-GLOBAL ID：201902221185985839 整理番号：19A1804755

ワンポット部位マッピングとグリカン分析によるペルメチル化による糖ペプチドの迅速分析のためのツール【JST・京大機械翻訳】

Tool for Rapid Analysis of Glycopeptide by Permethylation via One-Pot Site Mapping and Glycan Analysis

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資料名：
巻： 89 号： 20 ページ： 10734-10743 発行年： 2017年
JST資料番号： A0395A ISSN： 0003-2700 CODEN： ANCHAM 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

蛋白質グリコシル化の分析における課題を克服するために,グリコペプチドのパーメチル化とそれらのタンデム質量分析を通して包括的で普遍的なツールを開発した。この方法は,単一実験においてグリカン配列決定とグリコペプチド分析を統合することにより糖蛋白質分析を単純化する可能性を有する。さらに,酵素的または化学的放出に抵抗性のある原核生物由来のユニークなグリコシド結合を有するグリカンも検出され,この方法により分析された。ここでは,制御されたプロテアーゼ消化物を介して得られた無傷グリコペプチドのパーメチル化のための戦略と,それらの特性化を,高度な質量分析を用いて示した。この方法の実現可能性を実証するためのモデルとして,ウシRNアーゼB,ヒトトランスフェリンおよびウシのフェチュインを用いた。注目すべきことに,グリカンパターン,グリコシル化部位,及びN-グリカンによるそれらの占有はすべて検出され,単一の実験手順で同定された。高エネルギー衝突解離(HCD)及び衝突誘起解離(CID)のようなフラグメンテーション法による高分解能タンデムMS~nシステムの取得により,ペプチドに結合したグリカン構造の完全な配列が得られた。塩基性パーメチル化条件下での20種の天然アミノ酸の挙動を短い合成ペプチドのライブラリーをパーメチル化することにより調べた。著者らの研究は,パーメチル化がペプチド上で単純で,制限され,予測可能な化学変換を与え,MS/MSデータの解釈を妨げないことを示す。これに加えて,非還元型(β脱離により放出される)におけるペルメチル化O-グリカンも検出され,O-結合グリカン構造を同時にプロファイル化することを可能にした。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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質量分析

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