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J-GLOBAL ID：201902225038707430   整理番号：19A1395672

MALDI-MSによるClostridioides difficile MLST-1とMLST-11の認識のための2つのペプチドマーカーの同定と検証【JST・京大機械翻訳】

Identification and validation of two peptide markers for the recognition of Clostridioides difficile MLST-1 and MLST-11 by MALDI-MS

著者 (15件)： Corver J. (Leiden University Medical Centre, Centre of Infectious Diseases, Department Medical Microbiology, Section Experimental Bacteriology, Leiden, the Netherlands) ,  Corver J. (Centre for Microbiota Analysis and Therapeutics, Department Medical Microbiology, Leiden University, Leiden, the Netherlands) ,  Sen J. (Leiden University Medical Centre, Centre for Proteomics and Metabolomics, Leiden, the Netherlands) ,  Hornung B.V.H. (Leiden University Medical Centre, Centre of Infectious Diseases, Department Medical Microbiology, Section Experimental Bacteriology, Leiden, the Netherlands) ,  Hornung B.V.H. (Centre for Microbiota Analysis and Therapeutics, Department Medical Microbiology, Leiden University, Leiden, the Netherlands) ,  Mertens B.J. (Leiden University Medical Centre, Department of Medical Statistics and Bioinformatics, Leiden, the Netherlands) ,  Berssenbrugge E.K.L. (Leiden University Medical Centre, Centre of Infectious Diseases, Department Medical Microbiology, Section Experimental Bacteriology, Leiden, the Netherlands) ,  Harmanus C. (Leiden University Medical Centre, Centre of Infectious Diseases, Department Medical Microbiology, Section Experimental Bacteriology, Leiden, the Netherlands) ,  Sanders I.M.J.G. (Leiden University Medical Centre, Centre of Infectious Diseases, Department Medical Microbiology, Section Experimental Bacteriology, Leiden, the Netherlands) ,  Kumar N. (Host-Microbiota Interactions Laboratory, Wellcome Sanger Institute, Hinxton, UK) ,  Lawley T.D. (Host-Microbiota Interactions Laboratory, Wellcome Sanger Institute, Hinxton, UK) ,  Kuijper E.J. (Leiden University Medical Centre, Centre of Infectious Diseases, Department Medical Microbiology, Section Experimental Bacteriology, Leiden, the Netherlands) ,  Kuijper E.J. (Centre for Microbiota Analysis and Therapeutics, Department Medical Microbiology, Leiden University, Leiden, the Netherlands) ,  Hensbergen P.J. (Leiden University Medical Centre, Centre for Proteomics and Metabolomics, Leiden, the Netherlands) ,  Nicolardi S. (Leiden University Medical Centre, Centre for Proteomics and Metabolomics, Leiden, the Netherlands)
資料名： Clinical Microbiology and Infection  (Clinical Microbiology and Infection)
巻： 25  号： 7  ページ： 904.e1-904.e7  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3155A  ISSN： 1198-743X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Clostridioides difficile感染(CDI)は院内感染性下痢の主な原因となっている。異なるC.difficile株の広がりを調査し,制御するために,適切な迅速試験が必要である。本研究の目的は,マトリックス支援レーザ脱離/イオン化質量分析(MALDI-MS)によるC.difficile株の迅速認識のためのペプチド/蛋白質マーカーを同定することであった。超高分解能Fourier変換イオンサイクロトロン共鳴(FTICR)MSを用いて,8つの異なる多座配列型(MLST)に属する44の良く特性化された株を分析した。MLST-1およびMLST-11株に特異的な2つのペプチドマーカーのアミノ酸配列をMALDI-TOF-MS/MSにより解明した。2689のC.difficileゲノムの研究は,これらのマーカーの感度と特異性の決定を可能にした。C18-固相抽出を用いてMLST-1マーカーを濃縮した。2つのペプチドマーカー(m/z4927.81およびm/z5001.84)を同定し,それぞれMLST-1およびMLST-11株について特性化した。MLST-1マーカーは,3つがMLST-1に属しない786のゲノムで見つかった。MLST-11マーカーは319のゲノムで見つかり,そのうち14はMLST-11に属していなかった。重要なことに,すべてのMLST-1およびMLST-11ゲノムはそれぞれのマーカーに対して陽性であった。さらに,MLST-15に特異的なペプチドマーカー(m/z5015.86)を59ゲノムに見出した。MALDI-TOF-MSプラットフォーム上のMLST-1マーカーの明確な同定を可能にする迅速で簡単な方法に本知見を翻訳した。MALDI-FTICR MSに基づくペプチドプロファイリングは,C.difficile MLST-1およびMLST-11に対するペプチドマーカーの同定をもたらした。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： MALDI-TOF MS ,  タンパク質 ,  キャラクタリゼーション ,  脱着 ,  Fourier変換 ,  *ペプチド ,  アミノ酸配列 ,  固相抽出 ,  *MALDI-MS ,  ゲノム ,  イオン化 ,  レーザ
準シソーラス用語： プロファイリング ,  特異性 ,  *多座位配列タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Clostridioides difficile ,  マトリックス支援レーザ脱離/イオン化Fourier変換イオンサイクロトロン共鳴 ,  マトリックス支援レーザ脱離/イオン化飛行時間 ,  多遺伝子座配列タイピング ,  ペプチドマーカー ,  タイピング

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (6件)： MALDI-MS ,  MLST ,  ペプチド ,  マーカー ,  同定 ,  検証