文献

J-GLOBAL ID：201902225267647901   整理番号：19A1527898

34マイクロアレイデータセットの統合分析は,膠芽腫における診断および予後バイオマーカーとしてのCBX3を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Integrated analysis of 34 microarray datasets reveals CBX3 as a diagnostic and prognostic biomarker in glioblastoma

著者 (16件)： Wang Siqi (Department of Radiology, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Wang Siqi (Hubei Province Key Laboratory of Molecular Imaging, Wuhan, China) ,  Liu Fang (Department of Nuclear Medicine, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Wang Yuhui (Department of Radiology, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Wang Yuhui (Hubei Province Key Laboratory of Molecular Imaging, Wuhan, China) ,  Fan Wenliang (Department of Radiology, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Fan Wenliang (Hubei Province Key Laboratory of Molecular Imaging, Wuhan, China) ,  Zhao Hongyang (Department of Neurosurgery, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Liu Liying (Department of Radiology, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Liu Liying (Hubei Province Key Laboratory of Molecular Imaging, Wuhan, China) ,  Cen Chunyuan (Department of Radiology, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Cen Chunyuan (Hubei Province Key Laboratory of Molecular Imaging, Wuhan, China) ,  Jiang Xiaobin (Department of Neurosurgery, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Sun Min (Department of General Surgery, Taihe Hospital, Hubei University of Medicine, Shiyan, China) ,  Han Ping (Department of Radiology, Union Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, China) ,  Han Ping (Hubei Province Key Laboratory of Molecular Imaging, Wuhan, China)
資料名： Journal of Translational Medicine (Web)  (Journal of Translational Medicine (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 179  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7330A  ISSN： 1479-5876  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 膠芽腫は悪性度が高く,再発率が高く,死亡率が高く,治癒率が低い。膠芽腫の新しいマーカーの探索は,グリオーマの診断,予後および治療を改善するために非常に重要である。GEO公開データベースを用いて,1893のグリオーマサンプルを含む34のグリオーママイクロアレイデータセットを組み合わせて,統計解析,バイオクラスタ化,および経路分析を通して遺伝的データマイニングを実施した。結果を,TCGA,CGGA,および内部コホートにおいて検証した。さらに,その後の実験のための遺伝子を選択し,細胞増殖と細胞周期分析を行い,この遺伝子の生物学的機能を検証した。8つのグリア芽細胞特異的に発現した遺伝子をGEOを用いてスクリーニングした。TCGAおよびCGGAコホートにおいて,高いCBX3,BARD1,EGFRまたはIFRD1発現を有する患者は,有意により短い生存を有したが,高いGUCY1A3またはMOBP発現を有する患者は,これらの遺伝子のより低い発現を有する患者より有意に長い生存を有した。文献をレビューした後,さらなる実験のためにCBX3遺伝子を選択した。著者らは,CBX3が組織マイクロアレイの免疫組織化学的分析と外科標本のqPCR分析によってグリア芽細胞腫で過剰発現されたことを確認した。機能分析結果は,サイレンシングCBX3がG2/M期で細胞周期を停止させ,それにより細胞増殖能を弱めることを示した。著者らは,34のマイクロアレイデータセットにおける膠芽腫サンプルを分析するために学際的アプローチを使用し,膠芽腫患者における新しい診断および予後バイオマーカーを明らかにし,腫瘍マーカーをスクリーニングするための新しい方向を提供した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *バイオマーカー ,  *膠芽腫 ,  遺伝子 ,  神経膠腫 ,  EGF受容体 ,  *予後 ,  *診断 ,  母集団 ,  *DNAマイクロアレイ ,  遺伝子サイレンシング ,  細胞増殖 ,  定量的PCR法 ,  グリア細胞 ,  ヒト ,  遺伝
準シソーラス用語： 過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 神経膠芽腫 ,  バイオマーカー ,  診断 ,  予後 ,  特異的発現遺伝子

分類 (1件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (49件)：

• Acta Neuropathol; The 2007 WHO classification of tumours of the central nervous system; DN Louis, H Ohgaki, OD Wiestler, WK Cavenee, PC Burger, A Jouvet; 114; 2; 2007; 97-109; 10.1007/s00401-007-0243-4; citation_id=CR1
• Acta Neuropathol; The 2016 World Health Organization classification of tumors of the central nervous system: a summary; DN Louis, A Perry, G Reifenberger, A Deimling, D Figarella-Branger, WK Cavenee; 131; 6; 2016; 803-820; 10.1007/s00401-016-1545-1; citation_id=CR2
• N Engl J Med; Malignant gliomas in adults; PY Wen, S Kesari; 359; 5; 2008; 492-507; 10.1056/NEJMra0708126; citation_id=CR3
• N Engl J Med; Comprehensive, integrative genomic analysis of diffuse lower-grade gliomas; DJ Brat, RG Verhaak, KD Aldape, WK Yung, SR Salama; 372; 26; 2015; 2481-2498; 10.1056/NEJMoa1402121; citation_id=CR4
• Cancer Res; Gene expression-based classification of malignant gliomas correlates better with survival than histological classification; CL Nutt, DR Mani, RA Betensky, P Tamayo, JG Cairncross, C Ladd; 63; 7; 2003; 1602-1607; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： マイクロアレイデータ ,  統合 ,  分析 ,  膠芽腫 ,  診断 ,  予後 ,  バイオマーカー