文献

J-GLOBAL ID：201902225684151399   整理番号：19A1408140

力分光法と分子動力学シミュレーションを用いた分子スケールでの疎水性相互作用の解明【JST・京大機械翻訳】

Unraveling Hydrophobic Interactions at the Molecular Scale Using Force Spectroscopy and Molecular Dynamics Simulations

著者 (7件)： Stock Philipp (Department for Interface Chemistry and Surface Engineering, Max-Planck-Institut fuer Eisenforschung GmbH, Germany) ,  Monroe Jacob I. (Department of Chemical Engineering, University of California Santa Barbara, California, United States) ,  Utzig Thomas (Department for Interface Chemistry and Surface Engineering, Max-Planck-Institut fuer Eisenforschung GmbH, Germany) ,  Smith David J. (Department of Chemical Engineering, University of California Santa Barbara, California, United States) ,  Shell M. Scott (Department of Chemical Engineering, University of California Santa Barbara, California, United States) ,  Valtiner Markus (Department for Interface Chemistry and Surface Engineering, Max-Planck-Institut fuer Eisenforschung GmbH, Germany) ,  Valtiner Markus (Department for Physical Chemistry, Technische Universitaet Bergakademie Freiberg, Germany)
資料名： ACS Nano  (ACS Nano)
巻： 11  号： 3  ページ： 2586-2597  発行年： 2017年03月 
JST資料番号： W2326A  ISSN： 1936-0851  CODEN： ANCAC3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 疎水性部分間の相互作用は,生物学的物質の自己組織化を含む水性媒体中の普遍的な過程をより厳しくする。最近の数十年は巨視的疎水性界面に対するこれらの理解において大きな進歩を見ている。しかし,単一分子スケールでの疎水性相互作用(HIs)を実験的に測定し,理論と比較することは依然として課題である。ここでは,単一分子スケールでのペプチド系におけるHIsの配列依存性と加成性を直接測定し,定量化するための実験的シミュレーションアプローチを組み合わせた。著者らは,同じ系の平衡および非平衡,分子動力学(MD)シミュレーションの両方を完全に原子論的なモデルペプチドに動的単分子力分光法を組み合わせた。具体的には,疎水性ロイシン単量体の数の増加により柔軟な(GS)_5ペプチド足場を変異させ,疎水性自己集合単分子層表面からのペプチドの脱着を測定した。非平衡仕事軌跡の解析に基づいて,ロイシン当たり3.0~3.4k_BTで直線的にスケールする相互作用自由エネルギーを測定した。良好な一致において,シミュレーションは,ロイシン当たり2.1k_BTと同様の傾向を示し,一方,HIsへの詳細な分子的見解を提供した。このアプローチは,バイオ界面での相互作用や工業的応用での接着相互作用を含む広範囲の分野で,固体/液体界面での定性的および定量的単一分子相互作用を直接抽出するためのロードマップを提供する可能性がある。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 単量体 ,  加成性 ,  モデル ,  *分子動力学 ,  非平衡状態 ,  *計算機シミュレーション ,  *疎水性 ,  *疎水性相互作用 ,  *シミュレーション ,  分子間相互作用 ,  ペプチド ,  界面 ,  接着 ,  *相互作用 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  分枝鎖アミノ酸
準シソーラス用語： 単一分子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 単一分子力分光法 ,  AFM ,  分子動力学 ,  操縦分子動力学 ,  Jarzynskiの等式 ,  疎水性相互作用 ,  ペプチド ,  自己集合単分子層

分類 (1件)： 計算機シミュレーション  (JE11000H)

物質索引 (1件)： ロイシン

タイトルに関連する用語 (5件)： 力分光法 ,  分子動力学シミュレーション ,  分子 ,  スケール ,  疎水性相互作用