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J-GLOBAL ID：201902225766841041   整理番号：19A1709190

パーキンソン病における遺伝マーカーを同定するための遺伝子共発現ネットワーク分析-3方向比較アプローチ【JST・京大機械翻訳】

Gene co-expression network analysis for identifying genetic markers in Parkinson’s disease - a three-way comparative approach

著者 (7件)： George Gincy (Department of Bioinformatics, Karunya University, Karunya Nagar, Tamil Nadu 641114, India) ,  Singh Sachidanand (Department of Bioinformatics, Karunya University, Karunya Nagar, Tamil Nadu 641114, India) ,  Singh Sachidanand (Institute of Bio-Sciences and Technology, Shri Ramswaroop Memorial University, Deva Road, Uttar Pradesh 225003, India) ,  Lokappa Sowmya Bekshe (Department of Bioinformatics, Karunya University, Karunya Nagar, Tamil Nadu 641114, India) ,  Lokappa Sowmya Bekshe (Zilkha Neurogenetic Institute, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA) ,  Varkey Jobin (Department of Bioinformatics, Karunya University, Karunya Nagar, Tamil Nadu 641114, India) ,  Varkey Jobin (Zilkha Neurogenetic Institute, University of Southern California, Los Angeles, CA 90033, USA)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 111  号： 4  ページ： 819-830  発行年： 2019年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Parkinson病(PD)は,ドーパミン作動性ニューロンの進行性悪化を含む神経変性疾患である。家族性PDの遺伝的マーカーはほとんど知られていないが,散発性PDの病因はほとんど理解されていない。マイクロアレイデータを,PD患者由来の誘導多能性幹細胞(iPSC)およびこれらのiPSCから分化した成熟神経細胞(mDA)について分析した。発現と意味論的類似性を組み合わせて,確立されたParkinson病マーカー遺伝子の相互作用を含む高度に相関したPDインタクトームを構築した。トポロジー的および機能的に重要な遺伝子を描写する新しい3方向比較アプローチを用いた。これらの遺伝子は,パーキンユビキチン・プロテオソーム系(UPS),免疫関連生物学的過程およびアポトーシスのような経路への関与を示した。興味のあることは,細胞におけるPARK2活性に関連するeEF1A1,CASK,およびPSMD6の3つの遺伝子で,それによりPDを理解するための魅力的な候補遺伝子を形成する。本研究で記述されたネットワーク生物学アプローチは,重要な遺伝的調節因子の同定のための他の神経変性疾患に適用できる。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多能性幹細胞 ,  相互作用 ,  *Parkinson病 ,  ヒト ,  *ネットワーク ,  プロテアソーム ,  *遺伝子 ,  DNAマイクロアレイ ,  アポトーシス ,  ニューロン ,  病因 ,  位相幾何学
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  神経変性疾患 ,  *共発現 ,  *遺伝子マーカ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： αシヌクレイン ,  パーキンソン病 ,  遺伝子発現プロファイル ,  ネットワーク解析 ,  遺伝子オントロジー ,  微分共発現解析

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： パーキンソン病 ,  遺伝マーカー ,  同定 ,  遺伝子 ,  共発現 ,  ネットワーク分析 ,  3方向