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J-GLOBAL ID：201902226585228609   整理番号：19A1386077

領域保存演算のための多次元ゲノムデータ管理【JST・京大機械翻訳】

Multi-Dimensional Genomic Data Management for Region-Preserving Operations

著者 (4件)： Horlova Olha (Politecnico di Milano) ,  Kaitoua Abdulrahman (DFKI & TU-Berlin) ,  Markl Volker (DFKI & TU-Berlin) ,  Ceri Stefano (Politecnico di Milano)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2019  号： ICDE  ページ： 1166-1177  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： これまでの研究で,著者らは,遺伝的データ管理システム(GDMS)によってサポートされたゲノムデータセットを質問するための代数的言語である遺伝的質問言語(GMQL)を提示した。それは,Apache公園の上に実装されたオープンソース大規模データエンジンである。GMQLデータセットは,ゲノム領域(すなわち,ゲノムの間隔,開始と停止位置内に含まれる)と関連する値で表現され,その領域に関連するシグナル(遺伝子発現,発現のピーク,参照ゲノムに対する変異体)を表す。GMQLは異なるデータセット内で組織化された領域のビリオン上の質問を処理できる。本論文では,結果の領域がオペランドの一つの領域の部分集合である領域保存GMQL演算の効率的実行に焦点を当てた。ほとんどのGMQL操作は領域保存である。領域管理が価値管理から分離されることができる配列ベースのデータ組織化の利点を利用することによって,領域保存操作のチェーンを効率的に実行することができた。ここでは,この最適化について,現在のGDMSシステムの文脈において議論する。これは,rowベース(関係)組織を持ち,したがって,動的データ変換を必要とする。類似のアプローチは,区間ベースのデータ組織化を伴う他のアプリケーションドメインに適用される。Copyright 2019 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  *高次元 ,  言語 ,  遺伝 ,  代数学 ,  *演算 ,  チェーン ,  応用プログラム ,  ビリオン ,  部分集合 ,  最適化 ,  *データ管理
準シソーラス用語： オペランド ,  オープンソース ,  Apacheモジュール , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (4件)： 保存 ,  多次元 ,  ゲノム ,  データ管理