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J-GLOBAL ID：201902226825708260   整理番号：19A0711178

サケ科における熱ストレスに対する特異的分子バイオマーカーの開発【JST・京大機械翻訳】

Developing specific molecular biomarkers for thermal stress in salmonids

著者 (9件)： Akbarzadeh Arash (Fisheries and Oceans Canada, Pacific Biological Station, Nanaimo, Canada) ,  Akbarzadeh Arash (Department of Fisheries, Faculty of Marine Science and technology, University of Hormozgan, Bandar Abbas, Iran) ,  Guenther Oliver P (Guenther Analytics, Vancouver, Canada) ,  Houde Aimee Lee (Fisheries and Oceans Canada, Pacific Biological Station, Nanaimo, Canada) ,  Li Shaorong (Fisheries and Oceans Canada, Pacific Biological Station, Nanaimo, Canada) ,  Ming Tobi J (Fisheries and Oceans Canada, Pacific Biological Station, Nanaimo, Canada) ,  Jeffries Kenneth M (Department of Biological Sciences, University of Manitoba, Winnipeg, Canada) ,  Hinch Scott G (Pacific Salmon Ecology and Conservation Laboratory, Department of Forest and Conservation Sciences, University of British Columbia, Vancouver, Canada) ,  Miller Kristina M (Fisheries and Oceans Canada, Pacific Biological Station, Nanaimo, Canada)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 749  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 太平洋サケ(Oncorhynchus spp.)は魚類に対する気候温暖化効果の幅の良好な生物学的指標として役立つが,これは海洋及び淡水環境における環境問題にそれらを曝露するためである。著者らの研究は,鰓組織の非致死的サンプリングを用いて魚の慢性熱ストレスの分子生理学的特徴を監視できるロバストな熱応答性バイオマーカーを同定するために,魚類における広範な機能的ゲノム研究を行うことを試みた。鰓組織に対する候補熱ストレスバイオマーカーを,分子遺伝学研究所で生産されたマイクロアレイデータセット間の比較,太平洋生物学的ステーション,Nanimo,BC,6つの外部,公表されたマイクロアレイ研究を用いて同定し,深い文献マイニングを用いて複数の魚類における公表された研究を通して有意な遺伝子の比較を行った。39のユニークな遺伝子IDに関連する82のマイクロアレイの特徴を候補慢性熱ストレスバイオマーカーとして選択した。これらの遺伝子の大部分は,サケのマイクロアレイデータのメタ分析と,サケ科と他の魚類の熱ストレスマーカーの文献マイニングの両方で同定された。サケ種にわたる良好な効率を持つ32のユニークな遺伝子に対する定量的逆転写PCR(qRT-PCR)アッセイを開発し,5~7日にわたる熱的にチャレンジしたサケケ(O.nerka)とChook サケ(O.tshawytscha)(低温,13~14°C及び温暖温度18~19°C)に対する応答の活性を評価した。各々のSERPINH1とHSP90AA1,FKBP10,MAP3K14,Sfrs2,およびEEF2の2つの転写物を含む8つの遺伝子は,発見分析において一貫して強くてロバストな慢性温度ストレス応答を示した。発見分析と遺伝子発現の両方の結果は,シャペロニングと蛋白質救出,酸化ストレス,および蛋白質生合成に関与する遺伝子のパネルが,高温に応答して太平洋サケのえら組織において異なって活性化されたことを示した。個々に,これらのバイオマーカーのいくつかは他のストレス因子または生物学的プロセスに応答する可能性があるが,これらの遺伝子のいくつかすべてから成るバイオマーカーパネルが野外捕獲サケの熱ストレスを特異的に検出する信頼できる手段を提供できることを論じた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： パネル ,  ロバスト性 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  メタ分析 ,  *暑熱ストレス ,  低温 ,  太平洋 ,  DNAマイクロアレイ ,  捕獲 ,  遺伝子発現 ,  *バイオマーカー ,  *サケ科
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝子発現 ,  サケの適合チップ ,  バイオマーカー ,  太平洋サケ ,  熱応力

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (102件)：

• Nat Rev Genet; Fish as models for environmental genomics; AR Cossins, DL Crawford; 6; 2005; 324-333; 10.1038/nrg1590; citation_id=CR1
• J Exp Biol; What is environmental stress? Insights from fish living in a variable environment; PM Schulte; 217; 2014; 23-34; 10.1242/jeb.089722; citation_id=CR2
• Nature; Ecological responses to recent climate change; G Walther, E Post, P Convey, A Menzel, C Parmesan, TJC Beebee; 416; 2002; 389-395; 10.1038/416389a; citation_id=CR3
• Glob Change Biol; Effects of river temperature and climate warming on stock-specific survival of adult migrating Fraser River sockeye salmon (Oncorhynchus nerka); EG Martins, SG Hinch, DA Patterson, MJ Hague, SJ Cooke, KM Miller; 17; 2011; 99-114; 10.1111/j.1365-2486.2010.02241.x; citation_id=CR4
• Mol Ecol; Thermal adaptation and acclimation of ectotherms from differing aquatic climates; SR Narum, NR Campbell, KA Meyer, MR Miller, RW Hardy; 22; 2013; 3090-3097; 10.1111/mec.12240; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： サケ科 ,  熱ストレス ,  分子 ,  バイオマーカー ,  開発