文献

J-GLOBAL ID：201902226883582484   整理番号：19A0120136

[正則紙]デグサンプラ:E3結合部位を検出するための崩壊Gibbsサンプラー【JST・京大機械翻訳】

[Regular Paper] DegSampler: Collapsed Gibbs Sampler for Detecting E3 Binding Sites

著者 (2件)： Maruyama Osamu ,  Matsuzaki Fumiko
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2018  号： BIBE  ページ： 1-9  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文では,E3ユビキチンリガーゼ(E3s)に特異的な基質蛋白質における配列モチーフの発見の問題に取り組んだ。アミノ酸インデクシングに基づく尤度関数と蛋白質配列の無秩序性に基づく事前分布を設計することにより,サイトの事後確率分布を定式化した。これらの設計は,基質蛋白質におけるE3結合部位の既知の特性から誘導される。次に,著者らは,Degサンプラと呼ばれる事後確率分布のための崩壊Gibbsサンプリングアルゴリズムを考案した。E3sに特異的な36セットの基質蛋白質を用いて計算実験を行い,一般的モチーフファインダ,MEMEおよびGLAM2の性能と比較した。結果は,DegサンプラーがE3結合モチーフの発見において他より優れていることを示した。したがって,Degサンプラーは,基質蛋白質におけるE3モチーフを発見するための有望なツールである。Copyright 2019 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 基質 ,  タンパク質 ,  尤度関数 ,  ファインダ ,  アミノ酸配列 ,  定式化 ,  *結合部位 ,  事後確率 ,  アルゴリズム
準シソーラス用語： Gibbsサンプリング ,  事前分布 ,  ユビキチン-蛋白質リガーゼ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 図形・画像処理一般  (JE04010I)

タイトルに関連する用語 (3件)： 結合部位 ,  崩壊 ,  サンプラー