インドで循環するデングウイルスの部分的プレ膜とエンベロープ配列の系統発生分析【JST・京大機械翻訳】

Kasirajan Anand; Mammen Shoba; Kannangai Rajesh; Abraham Asha Mary

文献

J-GLOBAL ID：201902227215848941 整理番号：19A1947012

インドで循環するデングウイルスの部分的プレ膜とエンベロープ配列の系統発生分析【JST・京大機械翻訳】

Phylogenetic analysis of partial pre-membrane and envelope sequences of dengue viruses circulating in India

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資料名：
巻： 84 号： S ページ： S44-S56 発行年： 2019年
JST資料番号： W3271A ISSN： 1201-9712 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

循環インドデングウイルス(DENV)の系統発生特性を,部分的前膜(PrM)とエンベロープ(E)配列を用いて分析した。免疫優性領域を変異のために分析し,一般的DENV PCRプライマーとプローブによるアラインメントを決定した。公表されたインドのPrMとEDENV配列を,本研究サイトから今までに公表されていないPrM配列で分析した。DENVの配列を免疫優性領域における突然変異及び通常用いられるPCRプライマー及びプローブに対してチェックした。DENVの4つの血清型はインドで循環している。DENV-1の遺伝子型(G)GIIIとGIは,2012年前後に有意なPrM変異を伴う南で共循環した。DENV-2アメリカ遺伝子型は最初に報告された。その後,Cosmopolitan遺伝子型は南西部においてそれと共循環した。アジアのアメリカの遺伝子型が最近報告されているにもかかわらず,コスモpolitan株は唯一のDENV-2遺伝子型循環であった。DENV-2株のE領域に有意な変異が見られた。DENV-3株は国内でGIIIであった。南と西からのDENV-4GIはインドを横切って現在広がっている。DENV-3またはDENV-4では有意な変異は見られなかった。インド株はE遺伝子の免疫優性領域と通常用いられるPCRプライマーとプローブにより標的化された領域で変異を示した。多重遺伝子型の共循環によるインドDENVの遺伝的変動性は,遺伝子型サーベイランスがデングワクチンの組成を決定し,疫学,ウイルス適合性および病因へのそれらの寄与を理解するために重要であることを示唆する。E遺伝子の免疫優性領域で見られるいくつかの突然変異は,これらのウイルスが宿主免疫細胞を回避することを可能にする可能性がある。一般的に使用されているプライマーとプローブによって標的化された領域の突然変異は,より高い縮退を必要とする。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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感染症・寄生虫症一般

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