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J-GLOBAL ID：201902228038908596   整理番号：19A1358072

宜昌地区における結核菌遺伝子タイピングとクラスター形成特徴分析【JST・京大機械翻訳】

MIRU-VNTR genotyping and clustering of Mycobacterium tuberculosis isolates in Yichang

著者 (6件)： Liu Xiaojun (443000,湖北省宜昌市疾病預防控制中心検験科) ,  Yu Fenghua (443000,湖北省宜昌市疾病預防控制中心検験科) ,  Yu Yunfang (443000,湖北省宜昌市疾病預防控制中心検験科) ,  Ji Lv (443000,湖北省宜昌市疾病預防控制中心検験科) ,  Zhou Pan (443000,湖北省宜昌市疾病預防控制中心検験科) ,  Zhao Yanlin (中国疾病預防控制中心結核病預防控制中心国家結核病参比実験室)
資料名： Zhongguo Fang Lao Zazhi  (Zhongguo Fang Lao Zazhi)
巻： 41  号： 3  ページ： 308-314  発行年： 2019年 
JST資料番号： C3680A  ISSN： 1000-6621  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:宜昌地区の結核マイコバクテリアの遺伝子タイピング及びクラスター形成特徴を述べ、宜昌地区の結核病予防治療に根拠を提供する。方法:宜昌地区の2016年12月から2017年5月までに、遺伝子チップで陽性の結核患者痰サンプルを検査し、ロシック培地を接種して培養を行った。得られた367株の結核菌の臨床分離株は、国際的に通用する24部位結核菌散在分布反復単位及び可変数の直列反復配列(MIRU-VNTR)を選別し、分子タイピングを行った。Hunter-Gaston指数(HGI)と遺伝的差異値(h)を用いて,MIRUの分解能と差異を評価した。BioNumerics5.0ソフトウェアを使用して,VNTR-MIRUの結果をクラスター分析して,最近の伝搬率式に従って,最近の伝搬率を計算した。367の菌株が367例の患者から分離され、321例の初回治療患者と46例の復治患者に分けられ、初回再治療患者のクラスター形成率の比較はx2検定を用い、P<0.05は統計学的有意差があった。結果:367株の結核菌の24部位VNTR-MIRU分類の結果、その総分解能HGI値は0.999であり、そのうち、最も遺伝的多様性の高い部位はQUB11bであり、そのh値は0.79であった。最も低い遺伝的多様性の遺伝子座はMIRU24であり,そのh値は0.03であった。遺伝子型は明らかな多型を示し,合計324の遺伝子型があった。クラスター分析により、90株が39クラスターを形成し、クラスター形成率は24.52%(90/367)で、最近伝播率は13.90%(51/367)であった。再発率は21.74%(10/46)で,初期治療患者のクラスタ形成率は24.92%(80/321)であり,2群間のクラスター形成率に有意差はみられなかった(x2=0.220,P=0.639)。結論:宜昌地区の結核マイコバクテリアは比較的高い遺伝的多様性を呈し、近頃の伝播率は低く、しかもクラスター形成率は初復治と無関係であり、宜昌地区の結核マイコバクテリアは内燃再発を主とし、小範囲内の流行が存在し、結核の防止制御方面で重視する必要がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  *結核菌 ,  ヒト ,  分解能 ,  再発 ,  *結核 ,  クラスタ分析 ,  *クラスタ形成 ,  ソフトウェア ,  遺伝子型 ,  Mycobacterium ,  *クラスタ
準シソーラス用語： 菌株 ,  VNTR ,  縦列反復配列 ,  *遺伝子タイピング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 地区 ,  結核菌 ,  遺伝子タイピング ,  クラスター形成 ,  特徴分析