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J-GLOBAL ID：201902228144977507   整理番号：19A2039859

食品媒介汚染とコンプライアンスに用いる全ゲノム配列決定:全ゲノム配列決定を用いたアイスクリーム施設における新興汚染事象の発見【JST・京大機械翻訳】

Whole genome sequencing uses for foodborne contamination and compliance: Discovery of an emerging contamination event in an ice cream facility using whole genome sequencing

著者 (12件)： Allard Marc W. (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Strain Errol (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Rand Hugh (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Melka David (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Correll William A. (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Hintz Leslie (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Stevens Eric (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Timme Ruth (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Lomonaco Sara (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Chen Yi (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Musser Steven M. (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA) ,  Brown Eric W. (US Food and Drug Administration, 5001 Campus Drive, College Park, MD, USA)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 73  ページ： 214-220  発行年： 2019年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： FDAサーベイランスが,全ゲノム配列決定(WGS)が,アイスクリーム施設におけるリステリア菌汚染を含む事例における公衆衛生とコンプライアンスに対する活動可能な結果を改善する,何種類かの方法をレビューした。2017年8月後半に,FDAは氷クリーム施設内で環境サンプリングを実施した。これらの分離株を配列決定し,GenomeTrakrデータベースに沈着させた。2018年9月に,疾病管理と予防のためのセンターは,リステリア症の3つの臨床症例(2013年の2人,2018年の1人)の病原体分析が,2017年にアイスクリーム施設から収集した上記のリステリア菌分離株に高度に関連していることを見出した。FDAは2018年9月下旬にアイスクリーム施設に戻り,さらに環境サンプリングを行い,臨床事例に遺伝的に関連した環境副試料からリステリア菌を再び回収した。2017年8月から2018年10月までに製造されたすべてのアイスクリームを含むために,自発的な思い出しが発行された。その後,FDAはこの食品施設の登録を中止した。施設および臨床試料から見出されたリステリア菌に対するWGS結果は,0~31の一塩基多型(SNP)により一緒にクラスター化された。FDAは,疾病管理と予防のためのセンターと共に,また,フロリダ州のFlor田部門と,この施設により生産された全てのアイスクリーム製品を思い出すための農業と消費者サービスのフロリダ部門と一緒に働いた。著者らのデータは,食品施設検査から入手可能な分離株が全ゲノム配列決定を受け,その後の配列データがこれらの株と最近の臨床分離株(すなわち<20ヌクレオチド差)の間の結合を示すことを示唆する。コンプライアンス公式は更なる潜在的疾患を予防するために早期に調節作用を取るべきである。食品媒介病原体の文脈におけるFDAコンプライアンスプログラムの実施に関連する応用に対するWGSの有用性をレビューした。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝 ,  農業 ,  フロリダ州 ,  サーベイランス ,  公衆衛生 ,  *クリーム ,  クラスタ化 ,  リステリア菌 ,  データベース ,  *食品 ,  病原体 ,  *アイスクリーム ,  消費者 ,  分離株 ,  *ゲノム配列 ,  産業 ,  改変 ,  微生物

著者キーワード (6件)： コンプライアンス ,  感染制御 ,  全ゲノム配列決定 ,  Genometrakr ,  食品媒介病原菌 ,  NCBI病原体検出

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (8件)： 食品 ,  汚染 ,  コンプライアンス ,  ゲノム配列 ,  アイスクリーム ,  施設 ,  事象 ,  発見