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J-GLOBAL ID：201902228359760987   整理番号：19A1778147

C型肝炎ウイルス感染細胞および肝臓のメタボローム,プロテオームおよびトランスクリプトームの複合分析による疾患発生に関連する経路の同定【JST・京大機械翻訳】

Combined Analysis of Metabolomes, Proteomes, and Transcriptomes of Hepatitis C Virus-Infected Cells and Liver to Identify Pathways Associated With Disease Development

著者 (81件)： Lupberger Joachim (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Lupberger Joachim (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Croonenborghs Tom (Department of Neurology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts) ,  Croonenborghs Tom (Cell Circuits Program, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Croonenborghs Tom (Ann Romney Center for Neurologic Diseases, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Massachusetts) ,  Roca Suarez Armando Andres (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Roca Suarez Armando Andres (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Van Renne Nicolaas (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Van Renne Nicolaas (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Juehling Frank (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Juehling Frank (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Oudot Marine A. (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Oudot Marine A. (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Virzi Alessia (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Virzi Alessia (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Bandiera Simonetta (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Bandiera Simonetta (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Jamey Carole (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Jamey Carole (Laboratoire de Biochimie et de Biologie Moleculaire, Pole de biologie, Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Meszaros Gergo (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Meszaros Gergo (Institut de Genetique et de Biologie Moleculaire et Cellulaire, Illkirch, France) ,  Meszaros Gergo (Centre National de la Recherche Scientifique, Illkirch, France) ,  Meszaros Gergo (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Illkirch, France) ,  Brumaru Daniel (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Brumaru Daniel (Laboratoire de Biochimie et de Biologie Moleculaire, Pole de biologie, Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Mukherji Atish (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Mukherji Atish (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Durand Sarah C. (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Durand Sarah C. (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Heydmann Laura (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Heydmann Laura (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Verrier Eloi R. (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Verrier Eloi R. (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  El Saghire Hussein (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  El Saghire Hussein (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Hamdane Nourdine (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Hamdane Nourdine (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Bartenschlager Ralf (Department of Infectious Diseases, Molecular Virology, Heidelberg University, Heidelberg, Germany) ,  Bartenschlager Ralf (Division of Virus-Associated Carcinogenesis, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany) ,  Fereshetian Shaunt (The Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Ramberger Evelyn (Proteomics Platform, Max Delbrueck Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Society, Berlin, Germany) ,  Ramberger Evelyn (Berlin Institute of Health, Berlin, Germany) ,  Sinha Rileen (Department of Neurology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts) ,  Sinha Rileen (Cell Circuits Program, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Sinha Rileen (Ann Romney Center for Neurologic Diseases, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Massachusetts) ,  Nabian Mohsen (Department of Neurology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts) ,  Nabian Mohsen (Cell Circuits Program, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Nabian Mohsen (Ann Romney Center for Neurologic Diseases, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Massachusetts) ,  Everaert Celine (Department of Neurology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts) ,  Everaert Celine (Cell Circuits Program, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Everaert Celine (Ann Romney Center for Neurologic Diseases, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Massachusetts) ,  Jovanovic Marko (The Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Jovanovic Marko (Department of Biological Sciences, Columbia University, New York, New York) ,  Mertins Philipp (The Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Mertins Philipp (Proteomics Platform, Max Delbrueck Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Society, Berlin, Germany) ,  Mertins Philipp (Berlin Institute of Health, Berlin, Germany) ,  Carr Steven A. (The Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Chayama Kazuaki (Department of Gastroenterology and Metabolism, Applied Life Sciences, Institute of Biomedical and Health Sciences, Hiroshima University, Hiroshima, Japan) ,  Chayama Kazuaki (Liver Research Project Center, Hiroshima University, Hiroshima, Japan) ,  Dali-Youcef Nassim (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Dali-Youcef Nassim (Laboratoire de Biochimie et de Biologie Moleculaire, Pole de biologie, Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Dali-Youcef Nassim (Institut de Genetique et de Biologie Moleculaire et Cellulaire, Illkirch, France) ,  Dali-Youcef Nassim (Centre National de la Recherche Scientifique, Illkirch, France) ,  Dali-Youcef Nassim (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Illkirch, France) ,  Ricci Romeo (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Ricci Romeo (Institut de Genetique et de Biologie Moleculaire et Cellulaire, Illkirch, France) ,  Ricci Romeo (Centre National de la Recherche Scientifique, Illkirch, France) ,  Ricci Romeo (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Illkirch, France) ,  Bardeesy Nabeel M. (Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts) ,  Fujiwara Naoto (Liver Tumor Translational Research Program, Simmons Comprehensive Cancer Center, Division of Digestive and Liver Diseases, Department of Internal Medicine, University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, Texas) ,  Gevaert Olivier (Cell Circuits Program, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Gevaert Olivier (Stanford Center for Biomedical Informatics Research, Department of Medicine and Biomedical Data Science, Stanford University, Stanford, California) ,  Zeisel Mirjam B. (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Zeisel Mirjam B. (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Hoshida Yujin (Liver Tumor Translational Research Program, Simmons Comprehensive Cancer Center, Division of Digestive and Liver Diseases, Department of Internal Medicine, University of Texas Southwestern Medical Center, Dallas, Texas) ,  Pochet Nathalie (Department of Neurology, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts) ,  Pochet Nathalie (Cell Circuits Program, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, Massachusetts) ,  Pochet Nathalie (Ann Romney Center for Neurologic Diseases, Brigham and Women’s Hospital, Boston, Massachusetts) ,  Baumert Thomas F. (Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale, Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hepatiques, Universite de Strasbourg (IVH), Strasbourg, France) ,  Baumert Thomas F. (Universite de Strasbourg, Strasbourg, France) ,  Baumert Thomas F. (Pole Hepato-digestif, Institut Hopitalo-Universitaire, Strasbourg, France)
資料名： Gastroenterology  (Gastroenterology)
巻： 157  号： 2  ページ： 537-551.e9  発行年： 2019年 
JST資料番号： H0767A  ISSN： 0016-5085  CODEN： GASTAB  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： C型肝炎ウイルス(HCV)感染,肝疾患進行,および肝発癌の機構は,部分的に理解されている。著者らは,HCV感染細胞とキメラマウスのゲノム,プロテオミクス,およびメタボロミクス分析を行い,これらの過程をより多くの学習を行った。Huh7.5.1~dif(肝細胞様細胞)を培養由来HCVに感染させ,RNA配列決定,プロテオミック,メタボロミクス,および統合的ゲノム解析に用いた。uPA/SCID(ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子/重症複合免疫不全)マウスにHCV感染患者から血清を注入した。8週後に,肝臓組織を採取し,RNA配列決定とプロテオミクスによって分析した。示差発現,遺伝子セット濃縮分析,および蛋白質相互作用マッピングを用いて,HCV感染に応答して変化する経路を同定した。著者らは,肝細胞癌患者99名からのHCV感染および早期肝硬変患者216名および肝細胞癌患者99名からの肝組織の研究における著者らの知見を検証し,脂肪性肝炎の組織学的特徴を有する17名の患者を含んだ。HCV感染患者からの肝硬変肝組織を,相対的ペルオキシソーム機能に基づいて2つの群に分類した。評価した結果は,Child-Pughクラス,肝細胞癌の発生,生存,および脂肪性肝炎を含んでいた。肝細胞癌は,脂肪性肝炎によって分類した。結果は,相対的ペルオキシソーム機能であった。HCV感染細胞における21,950メッセンジャーRNA(mRNA)と8297蛋白質を定量した。肝細胞様細胞およびキメラマウスのHCV感染において,代謝および肝発癌に関与するmRNAおよび蛋白質レベルの有意な変化を観察した。肝細胞様細胞のHCV感染はmRNAレベルを有意に増加させたが,自然免疫応答を調節する蛋白質は増加させなかった。これはこれらの細胞における翻訳の阻害によるものと考えられる。肝細胞様細胞のHCV感染はグルコース消費と代謝およびSTAT3シグナル伝達経路を増加させ,ペルオキシソーム機能を低下させた。ペルオキシソームは非常に長鎖脂肪酸のβ-酸化を仲介する;HCV感染細胞における非常に長鎖脂肪酸の細胞内蓄積を見出し,脂肪肝疾患患者でも観察された。HCV感染マウスからの肝臓の細胞は,ペルオキシソーム機能に関連するmRNAと蛋白質のレベルの有意な減少を有し,ペルオキシソームの摂動を示した。著者らは,ペルオキシソーム機能における欠陥が患者におけるHCV関連肝硬変,脂肪肝疾患および肝細胞癌の結果および特徴と関連していることを見出した。HCV感染肝細胞様細胞およびHCV感染マウスからの肝臓組織のトランスクリプトーム,プロテオームおよびメタボローム分析を組み合わせた。HCV感染はグルコース代謝とSTAT3シグナル伝達経路を増加させ,それによりペルオキシソーム機能を低下させることを見出した。ペルオキシソーム遺伝子の発現レベルの変化は,肝疾患患者の転帰と関連していた。これらの知見は,肝臓疾患病因への洞察を提供し,新しい治療標的を同定するために使用される可能性がある。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病因 ,  遺伝子 ,  ヒト ,  *トランスクリプトーム ,  脂肪肝 ,  タンパク質 ,  プロテオミクス ,  肝硬変 ,  ペルオキシソーム ,  マウス ,  *プロテオーム ,  肝細胞癌 ,  RNA【核酸】 ,  mRNA
準シソーラス用語： メタボロミクス ,  *メタボローム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： HCC ,  シグナル伝達 ,  代謝疾患 ,  免疫調節

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (10件)： C型肝炎ウイルス感染 ,  細胞 ,  肝臓 ,  メタボローム ,  プロテオーム ,  トランスクリプトーム ,  分析 ,  疾患 ,  経路 ,  同定