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J-GLOBAL ID：201902228719367999   整理番号：19A1972845

カナダの草原における湖のhapto植物を同定するための次世代シークエンシング:温度プロキシ応用の重要性【JST・京大機械翻訳】

Next-Generation Sequencing to Identify Lacustrine Haptophytes in the Canadian Prairies: Significance for Temperature Proxy Applications

著者 (6件)： Plancq Julien (School of Geographical and Earth Sciences, University of Glasgow, Glasgow, UK) ,  Couto Jillian M. (School of Engineering, University of Glasgow, Glasgow, UK) ,  Ijaz Umer Z. (School of Engineering, University of Glasgow, Glasgow, UK) ,  Leavitt Peter R. (Limnology Laboratory, Department of Biology, University of Regina, Regina, Saskatchewan, Canada) ,  Leavitt Peter R. (Institute for Global Food Security, Queen’s University Belfast, Belfast, UK) ,  Toney Jaime L. (School of Geographical and Earth Sciences, University of Glasgow, Glasgow, UK)
資料名： Journal of Geophysical Research: Biogeosciences  (Journal of Geophysical Research: Biogeosciences)
巻： 124  号： 7  ページ： 2144-2158  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2384A  ISSN： 2169-8953  CODEN： JGREA2  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 北米の大平原は,主な経済的および環境的影響を持つ長期間の干ばつを経験することが多い。したがって,温度再構成は,干ばつ発生の原因となる機構を解読する助けとなるために重要である。長鎖アルケノン(LCAs),3つの主要な系統発生グループ(グループI,II,およびIII)によって産生された脂質は,Isochchryalesの範囲内で,湖沼環境における温度再構成のためにますます使用されている。しかしながら,LCAに基づく温度指標の最も適切なキャリブレーションを選択するために,最初に,LCA産生のハタ類種を同定することが必須である。ここでは,5つのカナダのプレーリー湖からのLCA生産者を同定するために,異なるLCAプロファイルを持つ堆積物から18S rRNAハプトフィート遺伝子を標的化するために次世代配列決定を用いた。全部で374の操作的分類単位(OTUs)が研究した試料を通して同定され,そのうち234はPhyllum Hapophyta内にあった。最も豊富なOTUsの中で,3つはLCA-生産者として特徴付けられ,1つはグループIハプトフィート内で,2つはグループIIハプトフィート内で特性化された。グループIハhapからのOTUは,単一の,高度に特異的なLCAプロファイルと関連していたが,グループII OTUsは,LCA分布においてより高い変動性を示した。著者らの研究は,カナダの湖におけるLCA産生OTUsの大部分がIsochrysis属の中に含まれていることを明らかにした。それはダウンコア温度再構成のための最も適切なキャリブレーションのガイド選択を助ける。著者らの知見はまた,温度依存性がグループIとグループIIのハタからの異なる分類群内で一貫している可能性があるが,他の環境パラメータはキャリブレーションの精度に影響する可能性があることを示唆する。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 再構成 ,  *草原 ,  キャラクタリゼーション ,  ターゲティング ,  長鎖 ,  系統発生 ,  *カナダ ,  干ばつ ,  遺伝子 ,  湖沼 ,  生産者
準シソーラス用語： アルケノン ,  Isochrysis ,  プレーリー ,  *湖 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アルケノン ,  湖沼 ,  ゲノム解析 ,  hapto植物 ,  温度 ,  代理開発

分類 (3件)： 水圏・生物圏の地球化学  (DD01030A) ,  海氷  (DC06050C) ,  生態系  (EE01040P)

タイトルに関連する用語 (9件)： カナダ ,  草原 ,  湖 ,  植物 ,  同定 ,  次世代シークエンシング ,  プロキシ ,  応用 ,  重要性