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J-GLOBAL ID:201902228984113734   整理番号:19A2041908

主要な東アジア人集団を識別するための祖先情報SNPパネル:漢民族,日本人,韓国人【JST・京大機械翻訳】

Ancestry informative SNP panels for discriminating the major East Asian populations: Han Chinese, Japanese and Korean
著者 (8件):
資料名:
巻: 83  号:ページ: 348-354  発行年: 2019年 
JST資料番号: T0210A  ISSN: 0003-4800  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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祖先情報マーカーは,医学的遺伝学および法医学的分析において重要な役割を果たす。いくつかの祖先情報のあるSNPパネルが開発され,検証されているが,それはグローバルな集団を大陸または主要な地域グループに区別することができる。これらのグローバルパネルは,良好な第一層遺伝子マーカーとして役立つ。しかし,地域内の個体群識別におけるそれらの性能は不十分である。地域集団に対する祖先推論を促進するために,各地域内のサブ集団間のより洗練された識別力を持つ第2層パネルを開発する必要がある。東アジアにおいて,中国人,日本人および韓国人は,高度に類似した外部可視特性を示し,遺伝的に密接に関連している。信頼できる祖先情報の遺伝的マーカーは,これらの個体群を識別するのに貴重であると思われる。本研究では,中国人(817人),韓国人(184人),日本人(100人)の合計1101人の非血縁者について,317,439のクリーンSNPを構成するゲノム全体のSNPデータセットを編集した。この開始データセットから,それぞれ36,59,98,および142のSNPを含む4つのネスト化された祖先情報のあるSNPパネルのセットを開発した。交差検証試験の結果は,これらのパネルが中国のHan,日本,韓国の個体群を90%から99%の範囲の全体的な平均精度で識別できることを示す。さらなる性能評価において,これらのパネルは高い感度と特異性を示した。第一層グローバルパネルと組み合わせて,これらの第二層パネルは,東アジアにおける医学的遺伝学および法医学研究に貢献するであろう。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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遺伝的変異 

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