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J-GLOBAL ID：201902229354017100   整理番号：19A1804478

複合プローブを用いたイネゲノムとトランスクリプトームからのGリッチ配列により形成されたG-四重鎖構造の検出【JST・京大機械翻訳】

Detection of G-Quadruplex Structures Formed by G-Rich Sequences from Rice Genome and Transcriptome Using Combined Probes

著者 (11件)： Chang Tianjun (Department of Biology, Institute of Resources and Environment, Henan Polytechnic University, People’s Republic of China) ,  Li Weiguo (Department of Biology, Institute of Resources and Environment, Henan Polytechnic University, People’s Republic of China) ,  Ding Zhan (Department of Biology, Institute of Resources and Environment, Henan Polytechnic University, People’s Republic of China) ,  Cheng Shaofei (Department of Biology, Institute of Resources and Environment, Henan Polytechnic University, People’s Republic of China) ,  Liang Kun (Department of Biology, Institute of Resources and Environment, Henan Polytechnic University, People’s Republic of China) ,  Liu Xiangjun (Beijing National Laboratory for Molecular Sciences, Key Laboratory of Analytical Chemistry for Living Biosystems, CAS Research/Education Center for Excellence in Molecular Sciences, Institute of Chemistry, Chinese Academy of Sciences, People’s Republic of China) ,  Liu Xiangjun (University of the Chinese Academy of Sciences, China) ,  Bing Tao (Beijing National Laboratory for Molecular Sciences, Key Laboratory of Analytical Chemistry for Living Biosystems, CAS Research/Education Center for Excellence in Molecular Sciences, Institute of Chemistry, Chinese Academy of Sciences, People’s Republic of China) ,  Bing Tao (University of the Chinese Academy of Sciences, China) ,  Shangguan Dihua (Beijing National Laboratory for Molecular Sciences, Key Laboratory of Analytical Chemistry for Living Biosystems, CAS Research/Education Center for Excellence in Molecular Sciences, Institute of Chemistry, Chinese Academy of Sciences, People’s Republic of China) ,  Shangguan Dihua (University of the Chinese Academy of Sciences, China)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 89  号： 15  ページ： 8162-8169  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 推定G-四重鎖(G4)形成配列(PQS)は様々な生物のゲノムとトランスクリプトームにおいて非常に一般的であり,G4構造を形成することにより多くの生物学的過程における潜在的調節要素と考えられている。G4構造の形成は,配列と環境に高度に依存する。ほとんどの場合,PQSによるG4形成,特にG2を含むPQSを予測することは困難である。したがって,G4形成の実験的同定はG4関連生物学的機能の研究に必須である。ここでは,一対の相補的レポーター,ヘミンおよびBMSPを用いることにより,G4構造の検出のための迅速で簡単な方法を報告した。この方法を適用して,ゲノムおよびトランスクリプトームにおいて探索されたPQS(DNAおよびRNA)によって形成されたG4構造を検出した。G4構造の一部を認識する報告されたG4プローブの大部分と異なり,結合プローブに基づく提案方法は,平行,反平行,混合/ハイブリッドG4を含むほとんど全てのG4立体配座に正に応答したが,非G4配列には応答しなかった。この方法はゲノム及びトランスクリプトームにおけるG4構造のハイスループット同定の可能性を示した。さらに,BMSPはいくつかのPQSを駆動し,より安定なG4構造を形成するか,または正常な生理学的条件でG4を形成できないいくつかのPQSのG4形成を誘導することが観察された。これは遺伝子調節の強力な分子ツールを提供する可能性がある。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  RNA【核酸】 ,  ヘミン ,  *トランスクリプトーム ,  *プローブ ,  生理学 ,  DNA【核酸】 ,  生物活性 ,  立体配座 ,  遺伝的調節 ,  調節遺伝子
準シソーラス用語： ハイスループット ,  生物学的過程 ,  *G-四重鎖 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  有機化合物の物理分析  (CC03034A)

タイトルに関連する用語 (5件)： プローブ ,  イネ ,  ゲノム ,  トランスクリプトーム ,  G-四重鎖