文献

J-GLOBAL ID：201902229499899466   整理番号：19A2656368

Fragaria vescaにおけるERF遺伝子の特性化と発現解析はタンデムERF重複の異なる多様性を示唆する【JST・京大機械翻訳】

Characterization and Expression Analysis of ERF Genes in Fragaria vesca Suggest Different Divergences of Tandem ERF Duplicates

著者 (8件)： Wang Xiaojing (1State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement and College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Lin Shanshan (1State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement and College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Liu Decai (1State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement and College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Wang Quanzhi (2Engineering and Technology Center for Modern Horticulture, Jiangsu Vocational College of Agriculture and Forestry, Zhenjiang, China) ,  McAvoy Richard (3Department of Plant Science and Landscape Architecture, University of Connecticut, Storrs, CT, United States) ,  Ding Jing (1State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement and College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Li Yi (1State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement and College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China) ,  Li Yi (3Department of Plant Science and Landscape Architecture, University of Connecticut, Storrs, CT, United States)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 10  ページ： 805  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： エチレン応答因子(ERF)は,植物の成長と発生および非生物的ストレスに対する応答において重要な役割を果たしている。しかし,Fragaria属とRosaceae科の遺伝的モデル植物である森林地帯イチゴ(Fragaria vesca)のERF遺伝子についてはほとんど情報が入手できなかった。本研究において,91のFveERF遺伝子が同定され,35配列がタンデムに配列し,タンデム重複がFveERFファミリーの拡大の主要機構であることを示した。Arabidopsis thalianaからのAtERFとのそれらの系統発生的関係によると,タンデムFveERF遺伝子は祖先および系統特異的タンデム型に分類できた。祖先のタンデムFveERFは,F.vescaとA.thalianaの共通祖先において起こるタンデム重複から誘導される可能性があるが,系統特異的なものはF.vesca系統に特異的に存在する。系統特異的タンデムFveERF重複は,配列と構造において祖先のものより保存されている。しかしながら,花と果実におけるそれらの発現は同様に多様化されており,タンデムFveERFがこの点で重複後に急速に分岐したことを示している。系統特異的タンデムFveERFは,干ばつまたは寒冷下で1つの例外を除いて同じ応答パターンを示し,一方,祖先のタンデム配列は大きく差次的に発現し,ストレス下でのタンデムFveERF発現の相違が生殖発生において後に起こる可能性を示唆した。著者らの結果は,タンデムFveERFの保持がそれらの重複が生殖発生の調節におけるそれらの相違に関連するかもしれないという証拠を提供する。対照的に,発現パターンにおけるそれらのさらなる相違は,非生物的ストレスに対する植物の応答に寄与する可能性がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 干ばつ ,  *遺伝子 ,  *遺伝 ,  *キャラクタリゼーション ,  高速度 ,  多様化 ,  *直列接続 ,  生殖 ,  バラ科 ,  Arabidopsis thaliana ,  *イチゴ属 ,  系統発生
準シソーラス用語： 遺伝子発現パターン ,  非生物的ストレス ,  *エゾヘビイチゴ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ERF遺伝子 ,  タンデム重複 ,  発散 ,  発現パターン ,  森林地帯のイチゴ

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (65件)：

• Agarwal P., Arora R., Ray S., Singh A. K., Singh V. P., Takatsuji H., et al. (2007). Genome-wide identification of C2H2 zinc-finger gene family in rice and their phylogeny and expression analysis. Plant Mol. Biol. 65, 467-485. doi: doi: 10.1007/s11103-007-9199-y
• Agarwal P. K., Agarwal P., Reddy M. K., Sopory S. K. (2006). Role of DREB transcription factors in abiotic and biotic stress tolerance in plants. Plant Cell Rep. 25, 1263-1274. doi: doi: 10.1007/s00299-006-0204-8
• Amil-Ruiz F., Garrido-Gala J., Blanco-Portales R., Folta K. M., Muñoz-Blanco J., Caballero J. L. (2013). Identification and validation of reference genes for transcript normalization in strawberry (Fragaria × ananassa) defense responses. PLoS ONE 8, e70603. doi: doi: 10.1371/journal.pone.0070603
• Bailey T. L., Johnson J., Grant C. E., Noble W. S. (2015). The MEME suite. Nucleic Acids Res. 43, W39-W49. doi: doi: 10.1093/nar/gkv416
• Banno H., Ikeda Y., Niu Q. W., Chua N. H. (2001). Overexpression of Arabidopsis ESR1 induces initiation of shoot regeneration. Plant Cell 13, 2609-2618. doi: doi: 10.1105/tpc.010234

タイトルに関連する用語 (6件)： Fragaria ,  ERF遺伝子 ,  特性化 ,  発現解析 ,  タンデム ,  多様性