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J-GLOBAL ID：201902229536028147   整理番号：19A1884356

RNA開裂の化学空間マッピングとリボザイム触媒作用に対するその意味【JST・京大機械翻訳】

Mapping the Chemical Space of the RNA Cleavage and Its Implications for Ribozyme Catalysis

著者 (9件)： Mlynsky Vojtech (Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Department of Physical Chemistry, Faculty of Science, Palacky University, Czech Republic) ,  Mlynsky Vojtech (Scuola Internazionale Superiore di Studi Avanzati (SISSA), Italy) ,  Kuehrova Petra (Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Department of Physical Chemistry, Faculty of Science, Palacky University, Czech Republic) ,  Jurecka Petr (Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Department of Physical Chemistry, Faculty of Science, Palacky University, Czech Republic) ,  Sponer Jiri (Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Department of Physical Chemistry, Faculty of Science, Palacky University, Czech Republic) ,  Sponer Jiri (Institute of Biophysics of the Czech Academy of Sciences, Czech Republic) ,  Otyepka Michal (Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Department of Physical Chemistry, Faculty of Science, Palacky University, Czech Republic) ,  Banas Pavel (Regional Centre of Advanced Technologies and Materials, Department of Physical Chemistry, Faculty of Science, Palacky University, Czech Republic) ,  Banas Pavel (Institute of Biophysics of the Czech Academy of Sciences, Czech Republic)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 121  号： 48  ページ： 10828-10840  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： リボザイムは多様な触媒戦略を利用する。RNA自己開裂の全ての化学的に実行可能な反応機構を比較することによりRNA開裂の触媒空間をマッピングする系統的量子化学計算を報告する。これはリボザイム触媒に直接関与する可能性のある化学基を含む適切なモデル系を用いる。モノアニオン及びジアニオン経路を経て進行する非触媒開裂反応の速度論を計算し,一般塩基(GB)及び/又は一般酸(GAs)又は静電遷移状態安定剤として作用する種々の基の効果を明確に調べた。全部で,115の異なる機構を調べた。ジアニオンシナリオは一般的にモノアニオン性シナリオに優先されるが,それらはいくつかの条件下で互いに競合する可能性がある。直接GA触媒作用は支配的な触媒効果を発揮するように思われるが,GB触媒作用と静電安定化はより効率的ではない。これらの結果は,触媒効果の支配的部分が,非触媒開裂の機構からリボザイムで生じる機構への反応機構のシフトにより説明できることを間接的に示唆した。これは典型的な蛋白質酵素と対照的であり,それらの触媒中心における全体的な静電効果による触媒作用を主に達成する。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 安定剤 ,  *リボザイム ,  アニオン ,  速度論 ,  反応機構 ,  開裂反応 ,  *RNA【核酸】 ,  モデル ,  酵素 ,  *触媒 ,  遷移状態 ,  タンパク質
準シソーラス用語： ジアニオン ,  量子化学計算 ,  *触媒作用 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (7件)： RNA ,  開裂 ,  化学 ,  空間マッピング ,  リボザイム ,  触媒作用 ,  意味