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J-GLOBAL ID：201902230009016074   整理番号：19A0920420

実証研究:潜在的に再精製可能な薬物を同定するためのオンラインツールとデータベースを結合するプロトコル【JST・京大機械翻訳】

Demonstration Study: A Protocol to Combine Online Tools and Databases for Identifying Potentially Repurposable Drugs

著者 (2件)： Chattopadhyay Aditi (Grade 12, Upper St. Clair High School, Pittsburgh, PA 15241, USA) ,  Ganapathiraju Madhavi K. (Department of Biomedical Informatics and Intelligent Systems Program, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA 15206, USA)
資料名： Data (Web)  (Data (Web))
巻： 2  号： 2  ページ： 15  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7170A  ISSN： 2306-5729  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 新薬の発見と開発のための伝統的な方法は,医薬品が米国食品医薬品局(FDA)によって承認される前に,化合物同定,前臨床および臨床試験のようないくつかの段階を含むので,非常に時間がかかり高価なプロセスである。したがって,現在FDA承認されている薬物を他の疾患に対する治療薬として用いることは,現在の薬物発見法に対するより迅速でより費用対効果の高い代替法であることが明らかになっている。本論文では,潜在的に浄化可能な薬剤を同定するために,オンラインデータベースとバイオインフォマティクスツールを用いてトランスクリプトームデータを分析するための3段階のin silicoプロトコルを記述した。このプロトコルの有効性は,最近報告された治療薬の2つの事例研究の知見と予測を比較することにより評価された:乾燥加齢黄斑変性の治療のためのHIV治療薬ジドブジンと小細胞肺癌のための抗うつイミプラミン。提案したプロトコルは公表された知見を成功裏に同定し,この方法の有効性を実証した。加えて,イミプラミンが治療やワクチンを現在使用しない疾患である重症急性呼吸症候群(SARS)を治療する可能性があるという発見を含めて,まだ公表されていないいくつかの新しい予測をもたらした。このin silicoプロトコルは使いやすく,高度な計算機スキルを必要としないので,これらのデータベースへのアクセスにより動機付けられた参加者は,将来の他の潜在的に浄化可能な薬剤を同定するために大きなデータセットに適用できる。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 事例研究 ,  新薬 ,  有効性 ,  米国食品医薬品局 ,  *プロトコル ,  *データベース ,  トランスクリプトーム ,  臨床試験 ,  小細胞肺癌 ,  計算機械 ,  ワクチン ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  第三アミン
準シソーラス用語： in silico ,  バイオインフォマティクス ,  *オンライン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 薬物再利用 ,  翻訳バイオインフォマティクス ,  トランスクリプトーム ,  トランスクリプトーム解析 ,  創薬 ,  計算プロトコル ,  遺伝子発現

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  抗原虫薬・駆虫薬の基礎研究  (GW17080G) ,  生物薬剤学(基礎)  (GY01021U)

物質索引 (1件)： イミプラミン

引用文献 (25件)：

• Hurle, M.R.; Yang, L.; Xie, Q.; Rajpal, D.K.; Sanseau, P.; Agarwal, P. Computational drug repositioning: From data to therapeutics. Clin. Pharmacol. Ther. 2013, 93, 335-341.
• Swinney, D.C.; Anthony, J. How were new medicines discovered? Nat. Rev. Drug Discov. 2011, 10, 507-519.
• Chong, C.R.; Sullivan, D.J. New uses for old drugs. Nature 2007, 448, 645-646.
• Ghofrani, H.A.; Osterloh, I.H.; Grimminger, F. Sildenafil: From angina to erectile dysfunction to pulmonary hypertension and beyond. Nat. Rev. Drug. Discov. 2006, 5, 689-702.
• Morales, D.R.; Morris, A.D. Metformin in cancer treatment and prevention. Annu. Rev. Med. 2015, 66, 17-29.

タイトルに関連する用語 (9件)： 実証 ,  研究 ,  精製 ,  薬物 ,  同定 ,  オンライン ,  ツール ,  データベース ,  プロトコル