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J-GLOBAL ID：201902230169327365   整理番号：19A1806715

グルタミン酸350は大腸菌クラスIAリボヌクレオチドレダクターゼにおける長距離ラジカル輸送の立体配座ゲーティングに不可欠な役割を果たす【JST・京大機械翻訳】

Glutamate 350 Plays an Essential Role in Conformational Gating of Long-Range Radical Transport in Escherichia coli Class Ia Ribonucleotide Reductase

著者 (9件)： Ravichandran Kanchana (Department of Chemistry, Massachusetts Institute of Technology) ,  Minnihan Ellen C. (Department of Chemistry, Massachusetts Institute of Technology) ,  Lin Qinghui (Department of Pathology and Pathophysiology, Key Laboratory of Disease Proteomics of Zhejiang Province, Research Center for Air Pollution and Health, Zhejiang University School of Medicine, China) ,  Yokoyama Kenichi (Department of Chemistry, Massachusetts Institute of Technology) ,  Taguchi Alexander T. (Department of Chemistry, Massachusetts Institute of Technology) ,  Shao Jimin (Department of Pathology and Pathophysiology, Key Laboratory of Disease Proteomics of Zhejiang Province, Research Center for Air Pollution and Health, Zhejiang University School of Medicine, China) ,  Nocera Daniel G. (Department of Chemistry and Chemical Biology, Harvard University, Massachusetts, United States) ,  Stubbe JoAnne (Department of Chemistry, Massachusetts Institute of Technology) ,  Stubbe JoAnne (Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology)
資料名： Biochemistry  (Biochemistry)
巻： 56  号： 6  ページ： 856-868  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0270B  ISSN： 0006-2960  CODEN： BICHAW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大腸菌クラスIaリボヌクレオチドレダクターゼ(RNR)は活性α2β2複合体を形成する2つのサブユニットから構成されている。ヌクレオシド二リン酸基質(NDP)は,β2において必須のジフェリチロシルラジカル(Y_122)補因子からα2,35Åで還元される。α/β界面を横切って,α2におけるC_439のY_122-媒介酸化は,β2からY_731←→Y_730←→C_439における経路(Y_122←→[W_48]←→Y_356)によって起こる。α2β2構造の欠如はサブユニット界面におけるY_356とY_731の位置への洞察を妨げる。β2における保存されたE_350からY_356の一次配列における近接性は,触媒作用および/または立体配座ゲーティングにおけるその重要性を示唆した。その機能を研究するために,3,5-ジフルオロチロシン(F_2Y)が残基356,731または両方を置換する野生型β2/α2および突然変異体のpH速度プロファイルをE_350またはE_350X(X=A,D,またはQ)変異体の存在下で報告した。E_350により,活性はpH極値で維持され,F_2Y_356とF_2Y_731のプロトン化と脱プロトン化状態は活性であり,ラジカル輸送(RT)は低pHでのプロトン結合電子移動または高pHでの電子移動により界面を横切って起こることを示唆した。E_350X突然変異体により,全てのRNRsは不活性であり,E_350が界面Ysの酸化中にプロトン受容体であることを示唆した。E_350が立体配座ゲーティングにおいて役割を果たすかどうかを決定するために,強い酸化剤,NO_2Y_122-β2および2,3,5-F_3Y_122-β2をE_350およびE_350X背景においてα2,CDPおよびATPと反応させ,反応を迅速凍結急冷電子常磁性共鳴分光法によって経路ラジカルに対してモニターした。経路ラジカルはE_350が存在する時にのみ生成され,RTを開始しプロトン受容体としての役割をマスキングする立体配座変化のゲーティングにおける必須の役割を支持する。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *リボヌクレオチドレダクターゼ ,  電子移動 ,  *立体配座 ,  酸化 ,  ヌクレオシド ,  サブユニット ,  陽子 ,  *大腸菌 ,  補因子 ,  界面 ,  配座転移 ,  *ラジカル ,  プロトン化 ,  複合体
準シソーラス用語： *ゲーティング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 酵素生理  (EG03052C) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (11件)： グルタミン酸 ,  大腸菌 ,  クラス ,  IA ,  リボヌクレオチドレダクターゼ ,  長距離 ,  ラジカル ,  輸送 ,  立体配座 ,  ゲーティング ,  役割