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J-GLOBAL ID：201902230958228540   整理番号：19A0714565

管腔乳癌の予後値によるメチル化部位と署名遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of methylation sites and signature genes with prognostic value for luminal breast cancer

著者 (18件)： Xiao Bin (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Chen Lidan (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Ke Yongli (Department of Breast Surgery, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Hang Jianfeng (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Cao Ling (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Zhang Rong (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Zhang Weiyun (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Liao Yang (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Gao Yang (Institute of Antibody Engineering, School of Biotechnology, Southern Medical University, Guangzhou, China) ,  Gao Yang (State Key Laboratory of Organ Failure, Institute of Antibody Engineering, School of Biotechnology, Southern Medical University, Guangzhou, China) ,  Gao Yang (Guangdong Provincial Key Laboratory of Tropical Disease Research, School of Public Health, Southern Medical University, Guangzhou, China) ,  Chen Jianyun (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Li Li (Department of Breast Surgery, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Hao Wenbo (Institute of Antibody Engineering, School of Biotechnology, Southern Medical University, Guangzhou, China) ,  Hao Wenbo (State Key Laboratory of Organ Failure, Institute of Antibody Engineering, School of Biotechnology, Southern Medical University, Guangzhou, China) ,  Hao Wenbo (Guangdong Provincial Key Laboratory of Tropical Disease Research, School of Public Health, Southern Medical University, Guangzhou, China) ,  Sun Zhaohui (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China) ,  Li Linhai (Department of Laboratory Medicine, General Hospital of Guangzhou Military Command of PLA, Guangzhou, China)
資料名： BMC Cancer (Web)  (BMC Cancer (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 405  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7305A  ISSN： 1471-2407  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 内腔乳癌に対するロバストで正確な分子予後予測因子が必要である。本研究は,予後を予測するための正確な分子ツールと同様に,内腔乳癌における重要なメチル化部位を同定することを目的とした。著者らは,癌ゲノムAtlasデータセットから正常および内腔乳癌サンプルのメチル化レベルを比較した。異なるメチル化部位,対応するmRNA発現レベルおよび予後の間の関係をさらに分析した。正常および癌試料における差次的に発現した遺伝子を分析し,続いて予後的特徴遺伝子の同定を行った。サンプルを,署名遺伝子に基づいて低および高リスク群に分割した。低および高リスク群の予後を比較した。遺伝子発現Omnibusデータセットを用いて,予後予測のための署名遺伝子を検証した。TCGAからのLuminal AおよびLuminal Bサンプルにおける低および高リスク群の予後およびMetabricコホートデータセットを分析した。また,低および高リスク群の臨床的特徴と遺伝子発現におけるそれらの差異の間の相関を分析した。14のメチル化部位は,それらのメチル化レベル,mRNA発現および予後が互いに密接に関連しているので,内腔乳癌予後に関連していると考えられた。Sostdc1のメチル化レベルを用いて,試料を低および高メチル化群に分割した。著者らはまた,8つの転写産物,ESCO2,PACSIN1,CDCA2,PIGR,PTN,RGMa,KLK4およびCENPAから成るmRNAシグネチャを同定した。これらは低および高リスク群に試料を分割するために使用された。低リスク群は,高リスク群より有意に良好な予後を示した。相関分析は,リスクスコアが独立予後因子であることを明らかにした。低および高リスク群はLuminal A試料における生存率と有意に相関したが,TCGAおよびMetabricコホートデータセットに基づいてLuminal B試料では相関しなかった。更なる機能的アノテーションは,差別的に発現した遺伝子が主に細胞周期と癌進行に関与していることを示した。著者らは,いくつかの重要なメチル化部位および管腔乳癌予後を予測するためのmRNAシグネチャを同定した。特徴は,予後の効果的で正確な予測を示し,内腔乳癌の予後および診断マーカーとして役立つ可能性がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  遺伝子発現 ,  mRNA ,  *乳房腫瘍 ,  ロバスト性 ,  アノテーション ,  生存率 ,  *予後 ,  *メチル化 ,  細胞周期
準シソーラス用語： 腫瘍進行 ,  相関分析 ,  予後予測 ,  mRNA発現 ,  予後因子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 管腔乳癌 ,  メチル化 ,  mRNA ,  予後 ,  SOSTDC1

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (43件)：

• The lancet oncology; Breast cancer in China; L Fan, K Strasser-Weippl, J-J Li, J St Louis, D Finkelstein, K-D Yu, W-Q Chen, Z-M Shao, P Goss; 15; 7; 2014; e279-e289; 10.1016/S1470-2045(13)70567-9; citation_id=CR1
• J Clin Oncol; Molecular classification and molecular forecasting of breast cancer: ready for clinical application?; J Brenton, L Carey, A Ahmed, C Caldas; 23; 29; 2005; 7350-7360; 10.1200/JCO.2005.03.3845; citation_id=CR2
• Nature; Molecular portraits of human breast tumours; C Perou, T Sorlie, M Eisen, M van de Rijn, S Jeffrey, C Rees, J Pollack, D Ross, H Johnsen, L Akslen; 406; 6797; 2000; 747-752; 10.1038/35021093; citation_id=CR3
• Epigenomics; Epigenetic mechanisms of breast cancer: an update of the current knowledge; S Karsli-Ceppioglu, A Dagdemir, G Judes, M Ngollo, F Penault-Llorca, A Pajon, Y Bignon, D Bernard-Gallon; 6; 6; 2014; 651-664; 10.2217/epi.14.59; citation_id=CR4
• Nat Genet; Epigenetic regulation of gene expression: how the genome integrates intrinsic and environmental signals; R Jaenisch, A Bird; 33; Suppl; 2003; 245-254; 10.1038/ng1089; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： 管 ,  乳癌 ,  予後値 ,  メチル化 ,  署名 ,  遺伝子 ,  同定