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J-GLOBAL ID：201902231047974476   整理番号：19A1650180

ヨーロッパのブタとイノシシにおけるSalmonella choleraesuis var.kunzendorfの交差境界伝播:感染,遺伝学および進化【JST・京大機械翻訳】

Cross-Border Transmission of Salmonella Choleraesuis var. Kunzendorf in European Pigs and Wild Boar: Infection, Genetics, and Evolution

著者 (17件)： Leekitcharoenphon Pimlapas (European Union Reference Laboratory for Antimicrobial Resistance, WHO Collaborating Center for Antimicrobial Resistance in Food Borne Pathogens and Genomics, Research Group for Genomic Epidemiology, National Food Institute, Kongens Lyngby, Denmark) ,  Sorensen Gitte (European Union Reference Laboratory for Antimicrobial Resistance, WHO Collaborating Center for Antimicrobial Resistance in Food Borne Pathogens and Genomics, Research Group for Genomic Epidemiology, National Food Institute, Kongens Lyngby, Denmark) ,  Lofstrom Charlotta (RISE Research Institutes of Sweden, Lund, Sweden) ,  Battisti Antonio (Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Lazio e della Toscana, National Reference Laboratory for Antimicrobial Resistance, Rome, Italy) ,  Szabo Istvan (National Salmonella Reference Laboratory, Unit Molecular Microbiology and Genome Analysis, Federal Institute for Risk Assessment, Berlin, Germany) ,  Wasyl Dariusz (National Veterinary Research Institute Department of Microbiology, National Reference Laboratory for Salmonellosis and Antimicrobial Resistance, Pulawy, Poland) ,  Slowey Rosemarie (Department of Agriculture, Food and the Marine Laboratories, Celbridge, Ireland) ,  Zhao Shaohua (Division of Animal and Food Microbiology, Center for Veterinary Medicine, United States Food and Drug Administration, Laurel, MD, United States) ,  Brisabois Anne (French Agency for Food, Environmental and Occupational Health and Safety, Maisons-Alfort, France) ,  Kornschober Christian (NRC Salmonella, Austrian Agency for Health and Food Safety, Graz, Austria) ,  Kaerssin Age (Veterinaar- ja Toidulaboratoorium, Tartu, Estonia) ,  Szilard Janosi (Bakteriologiai Laboratorium, Allategeszseguegyi Diagnosztikai Igazgatosag, Nemzeti Elelmiszerlanc-biztonsagi Hivatal, Budapest, Hungary) ,  Cerny Tomas (Statni Veterinarni Ustav Praha, Prague, Czechia) ,  Svendsen Christina Aaby (European Union Reference Laboratory for Antimicrobial Resistance, WHO Collaborating Center for Antimicrobial Resistance in Food Borne Pathogens and Genomics, Research Group for Genomic Epidemiology, National Food Institute, Kongens Lyngby, Denmark) ,  Pedersen Karl (National Veterinary Institute, Technical University of Denmark, Kongens Lyngby, Denmark) ,  Aarestrup Frank M. (European Union Reference Laboratory for Antimicrobial Resistance, WHO Collaborating Center for Antimicrobial Resistance in Food Borne Pathogens and Genomics, Research Group for Genomic Epidemiology, National Food Institute, Kongens Lyngby, Denmark) ,  Hendriksen Rene S. (European Union Reference Laboratory for Antimicrobial Resistance, WHO Collaborating Center for Antimicrobial Resistance in Food Borne Pathogens and Genomics, Research Group for Genomic Epidemiology, National Food Institute, Kongens Lyngby, Denmark)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 179  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Salmonella enterica亜種enterica血清型Choleraesuisはブタ適応血清型である。S.コレラ変種Kunzendorfはブタ間の大多数の発生の原因である。S.1999~2000年および2012~2013年のデンマークにおける2つの発生を含むブタにおいて深刻な発生があるにもかかわらず,コレラはヨーロッパにおいてまれである。ここでは,デンマークの流行分離株を含むヨーロッパのS.Choleraesuis分離株の疫学,可能な伝達経路と発生源,およびクローン性を明らかにする。異なるヨーロッパ諸国と米国からの合計102のS.Choleraesuis分離株を,過去20年から利用可能な分離株をカバーして,全ゲノム配列決定のために選択した。時間的および空間的系統樹を再構成するために,Bayesフレームワーク内で時間的に構造化されたシーケンス解析を適用した。MLST型,抵抗性遺伝子,プラスミドレプリコン,および付属遺伝子を,バイオインフォマティクスツールを用いて同定した。野生イノシシからの12株のうち11株を含む58分離株は汎感受性であった。残りの分離株は複数の耐性遺伝子を保有した。8つのプラスミドにおける11の異なるプラスミドレプリコンを分離株の間で測定した。付属遺伝子は同定された耐性遺伝子とプラスミドに関連していた。ヨーロッパのS.Choleraesuisは,1.02SN/ゲノム/年の突然変異率で,~1837(95%信頼区間,1733~1983)に出現したと推定された。分離株は国と近隣諸国に従ってクラスタ化された。米国とヨーロッパ諸国からの株間には,伝染イベントがあった。野生イノシシとブタ分離株は遺伝的に連鎖し,野生生物貯留層による交差境界伝達と透過を示唆した。系統樹は,複数の導入がデンマークにおける2012~2013年の発生の原因であることを示し,デンマークへの境界を横切る不十分な消毒された車両が潜在的に発生源であることを示唆している。低レベルの一塩基多型(SNP)差(0-4SNPs)は,同じ動物の異なる器官から分離されたクローン株間で観察される。家畜の適切な殺菌と家畜飼料の改善された品質管理は,ヨーロッパのブタ生産システムにおけるアフリカのブタ熱(ASF)のような,S.Choleraesuisの将来の普及を防ぐのに役立つか,または他のより深刻な感染症を予防するのを助けることができた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： レプリコン ,  クラスタ化 ,  血清型 ,  *ヨーロッパ ,  クローン ,  系統樹 ,  感受性 ,  デンマーク王国 ,  *遺伝 ,  家畜 ,  動物 ,  *サルモネラ属 ,  プラスミド ,  疫学
準シソーラス用語： 分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： Salmonella choleraesuis ,  Kunzendorf ,  疫学 ,  全ゲノム配列決定 ,  系統学 ,  伝送 ,  イノシシ ,  抗菌薬耐性遺伝子

分類 (2件)： 微生物生理一般  (EG03051L) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (52件)：

• Altschul S. F., Gish W., Miller W., Myers E. W., Lipman D. J. (1990). Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. 215 403-410. doi: 10.1016/S0022-2836(05)80360-2
• Baggesen D., Christensen J., Jensen T., Skov M., Sørensen G., Sørensen V. (2000). Udbrud af Salmonella enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis var. Kunzendorf (S. Choleraesuia) i en dansk svinebesætning. Dansk Veterinærtidsskrift 83 6-12. doi: 10.1016/S0022-2836(05)80360-2
• Barnes D., Sorensen D. (1975). “"Salmonellosis,"” in Diseases of Swine, eds Dunne H. W., Leman A. (Ames: Iowa State University Press), 554-564. doi: 10.1016/S0022-2836(05)80360-2
• Bielejec F., Baele G., Vrancken B., Suchard M. A., Rambaut A., Lemey P. (2016). SpreaD3: interactive visualization of spatiotemporal history and trait evolutionary processes. Mol. Biol. Evol. 33 2167-2169. doi: 10.1093/molbev/msw082
• Biester H. (1958). Diseases of Swine. Ames: The Iowa State College Press, 317-333. doi: 10.1093/molbev/msw082

タイトルに関連する用語 (10件)： ヨーロッパ ,  ブタ ,  イノシシ ,  Salmonella ,  交差 ,  境界 ,  伝播 ,  感染 ,  遺伝学 ,  進化