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J-GLOBAL ID：201902231076192800   整理番号：19A1407875

原核生物プロピオニル化の計算予測と機能解析【JST・京大機械翻訳】

Computing Prediction and Functional Analysis of Prokaryotic Propionylation

著者 (7件)： Wang Li-Na (College of Chemistry and Institute for Advanced Study, Nanchang University, China) ,  Wang Li-Na (Department of Sciences, Nanchang Institute of Technology, China) ,  Shi Shao-Ping (College of Chemistry and Institute for Advanced Study, Nanchang University, China) ,  Wen Ping-Ping (College of Chemistry and Institute for Advanced Study, Nanchang University, China) ,  Zhou Zhi-You (College of Chemistry and Institute for Advanced Study, Nanchang University, China) ,  Qiu Jian-Ding (College of Chemistry and Institute for Advanced Study, Nanchang University, China) ,  Qiu Jian-Ding (Department of Materials and Chemical Engineering, Pingxiang University, China)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 57  号： 11  ページ： 2896-2904  発行年： 2017年11月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質プロピオニル化の候補の同定と系統的分析は,その分子機構と生物学的機能を理解するための重要なステップである。潜在的なプロピオニル化蛋白質を明らかにするために,いくつかのプロテオミックスケール法が行われているが,リジン-プロピオニル化基質の大部分と病理生理学におけるそれらの役割は依然としてほとんど知られていない。種々のデータベースと文献を収集することにより,実験的原核生物のプロピオニル化データを,3段階特徴選択法により種々の特徴を持つサポートベクトルマシンで訓練するために照合した。潜在的リジン-プロピオニル化部位(PropSeek)(http://bioinfo.ncu.edu.cn/PropSeek.aspx)を探索するための新しいオンラインツールを構築した。leave-one-outとn-fold交差検証の独立した試験結果は互いに類似しており,PropSeekは満足な性能を有する安定でロバストな予測子であることを示した。一方,Gene Ontologyの分析,Gen及びGenomes経路の京都Encyclopedia,及び蛋白質-蛋白質相互作用は蛋白質合成及び代謝における原核生物プロピオニル化の潜在的役割を示唆した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病態生理 ,  ロバスト性 ,  タンパク質 ,  基質 ,  特徴選択 ,  *予測 ,  データベース ,  *原核生物 ,  サポートベクトルマシン ,  *機能分析 ,  京都府
準シソーラス用語： 蛋白質間相互作用 ,  予測子 ,  オンライン ,  分子機構 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子化合物  (CE02000C)

タイトルに関連する用語 (4件)： 原核生物 ,  計算 ,  予測 ,  機能解析