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J-GLOBAL ID：201902231612993358   整理番号：19A2607892

主成分分析によるGWASはイネ構造を制御する遺伝子を同定する【JST・京大機械翻訳】

GWAS with principal component analysis identifies a gene comprehensively controlling rice architecture

著者 (18件)： Yano Kenji (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Yano Kenji (Statistical Genetics Team, RIKEN Center for Advanced Intelligence Project, Nihonbashi, 103-0027 Tokyo, Japan) ,  Morinaka Yoichi (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Wang Fanmiao (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Huang Peng (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Takehara Sayaka (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Hirai Takaaki (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Ito Aya (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Koketsu Eriko (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Kawamura Mayuko (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Kotake Kunihiko (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Yoshida Shinya (Hyogo Prefectural Research Center for Agriculture, Forestry and Fisheries, Kasai, 679-0198 Hyogo, Japan) ,  Endo Masaki (Institute of Agrobiological Sciences, National Agriculture and Food Research Organization, 305-8634 Tsukuba, Japan) ,  Tamiya Gen (Statistical Genetics Team, RIKEN Center for Advanced Intelligence Project, Nihonbashi, 103-0027 Tokyo, Japan) ,  Kitano Hidemi (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Ueguchi-Tanaka Miyako (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Hirano Ko (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan) ,  Matsuoka Makoto (Bioscience and Biotechnology Center, Nagoya University, 464-8601 Nagoya, Japan)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 116  号： 42  ページ： 21262-21267  発行年： 2019年 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： イネ構造の遺伝的制御の解明は,高い作物収量のためのグローバルな需要のために重要である。イネの構造は植物の高さ,分げつ,穂の形態に影響される複雑な形質である。本研究において,植物構造に関連する8つの典型的特性に関する主成分分析(PCA)は,最初の主成分(PC),PC1がイネ構造を決定する形質に関する最も多くの情報を提供することを明らかにした。依存変数としてPC1を用いたゲノムワイド関連研究(GWAS)を用いて,ジベレリン(GA)シグナル抑制蛋白質SLR1を活性化するイネ,SPINDLY(OsSPY)をコードする遺伝子を単離した。イネ構造の調節に及ぼすGAシグナル伝達の影響を,異なるレベルのGA応答性を持つ9種類の同質遺伝子植物において確認した。さらなる個体群遺伝学的分析により,イネ育種の過程において,半矮性と小穂に関連するOsSPYの機能的対立遺伝子が選択されることを示した。要約すると,GWASにおけるPCAの使用は複雑な特性を持つ形質に関与する遺伝子の発見に役立つであろう。Copyright 2019 The Author(s). Published by PNAS. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  集団遺伝 ,  遺伝的調節 ,  育種 ,  *主成分分析 ,  *ゲノムワイド関連解析 ,  対立遺伝子 ,  ジベレリン ,  細胞情報伝達 ,  分蘖 ,  作物収量
準シソーラス用語： 小穂 ,  半矮性 ,  同質遺伝子 ,  植物構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： プラントアーキテクチャ ,  PCA ,  GWAS ,  ジベレリン ,  スピンドル

分類 (5件)： 稲作  (FC03020C) ,  発生,成長,分化  (EH02030U) ,  植物ホルモン  (EH02070M) ,  細菌による植物病害  (FC04053P) ,  植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 主成分分析 ,  GWAS ,  イネ ,  遺伝子 ,  同定