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J-GLOBAL ID：201902231996494510   整理番号：19A1804673

ASSAYR:標的化代謝および安定同位体トレーサ分析のための単純な質量分析ソフトウェアツール【JST・京大機械翻訳】

AssayR: A Simple Mass Spectrometry Software Tool for Targeted Metabolic and Stable Isotope Tracer Analyses

著者 (3件)： Wills Jimi (Cancer Research UK Edinburgh Centre, Institute of Genetics and Molecular Medicine, University of Edinburgh, United Kingdom) ,  Edwards-Hicks Joy (Cancer Research UK Edinburgh Centre, Institute of Genetics and Molecular Medicine, University of Edinburgh, United Kingdom) ,  Finch Andrew J. (Cancer Research UK Edinburgh Centre, Institute of Genetics and Molecular Medicine, University of Edinburgh, United Kingdom)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 89  号： 18  ページ： 9616-9619  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 代謝分析は一般的に2つのクラスに分類される:非バイアス代謝分析と特異的代謝産物に向けて標的化される分析。両技術は,飛行時間(TOFs)やOrbitrapsのような高い質量精度と分解能を与える検出器による質量分析計の出現によって革命化されてきた。これらの分光計の分解能が13C含有同位体と15Nまたは他の同位体を含むそれらの間の識別を可能にするので,この技術が重要な一つの特別な領域は代謝フラックス分析の分野にある。XCMSに基づくソフトウェアは質量分析データセットの非標的分析に自由に利用できるが,標的アッセイにおける興味のある代謝産物を常に同定しない。さらに,代謝産物と同位体の標的分析を扱うベンダー非依存性ソフトウェアの不足がある。ここでは,高分解能広走査液体クロマトグラフィー-質量分析(LC-MS)データセットを取り,単純で反復的なユーザインターフェースを通して各代謝産物に対するピーク検出を調整するRパッケージ,AssayRを提示した。それはすべての同位体に対するピーク面積を自動的に統合し,抽出したイオンクロマトグラム(EIC),絶対的及び相対的に積層したバーチャートを全ての同位体及びcsvデータファイルに対して統合した。AssayRがXCMSよりも正確でロバストな定量を提供するいくつかの例を示し,調整されたピーク検出が標的分析のための優先的アプローチであることを提案した。まとめると,AssayRは,高分解能質量分析計からの広い走査データセットに関する容易でロバストな標的代謝産物と安定同位体分析を提供する。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *代謝 ,  LC-MS分析 ,  検出器 ,  *ソフトウェア ,  *支援プログラム ,  *ターゲティング ,  分光計 ,  *同位体 ,  *質量分析 ,  代謝産物 ,  質量分析計 ,  走査 ,  バイアス ,  ロバスト性
準シソーラス用語： ピーク検出 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 代謝一般  (EB02030C) ,  質量分析  (CC03013N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 標的化 ,  代謝 ,  安定同位体トレーサ ,  分析 ,  質量分析 ,  ソフトウェアツール