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J-GLOBAL ID：201902232455216486   整理番号：19A0880882

化学自由エネルギー計算を用いたオクタノール-水分配係数に及ぼす原子電荷の影響【JST・京大機械翻訳】

Effect of Atomic Charges on Octanol-Water Partition Coefficient Using Alchemical Free Energy Calculation

著者 (3件)： Ogata Koji (RIKEN Innovation Center, Nakamura Laboratory, 2-1 Hirosawa, Wako, Saitama 351-0198, Japan) ,  Hatakeyama Makoto (RIKEN Innovation Center, Nakamura Laboratory, 2-1 Hirosawa, Wako, Saitama 351-0198, Japan) ,  Nakamura Shinichiro (RIKEN Innovation Center, Nakamura Laboratory, 2-1 Hirosawa, Wako, Saitama 351-0198, Japan)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 23  号： 2  ページ： 425  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： オクタノール-水分配係数(logPow)は,薬物発見分野における溶解度,膜透過性,およびバイオアベイラビリティを測定するための重要な指標である。本論文では,分子動力学シミュレーションを用いた無化学的自由エネルギー計算により58化合物のlogPow値を予測した。自由エネルギー計算において,化合物の原子電荷は常に固定されている。しかし,それらは各溶媒に対して再計算されなければならない。したがって,真空,オクタノール,および水環境を考慮して,量子化学計算を用いて3つの異なる原子電荷セットを試験した。異なる環境における計算された原子電荷は,計算値と実験的に測定されたΔGwater値の間の相関に必ずしも影響しない。水中及びオクタノール中の溶媒和自由エネルギーの最大相関係数値はそれぞれ0.93及び0.90であった。一方,自由エネルギーから計算したlogPow値の相関係数は0.92で,計算した原子電荷から計算した溶媒和自由エネルギーの組合せに敏感であった。これらの結果は,原子電荷計算において仮定された溶媒が,予測されたlogPow値の精度を決定する重要な因子であることを明らかにした。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  溶解度 ,  バイオアベイラビリティ ,  *自由エネルギー ,  *電荷 ,  相関係数 ,  溶媒和 ,  計算機シミュレーション ,  熱力学的積分 ,  計算値 ,  量子化学計算 ,  水環境 ,  分子動力学シミュレーション ,  計算機利用 ,  利用
準シソーラス用語： 相関係 ,  膜透過性 ,  *自由エネルギー計算 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： MDシミュレーション ,  熱力学的積分 ,  溶媒和環境 ,  原子電荷

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  ピリジン  (CF07095Q)

引用文献 (57件)：

• Hansch, C.; Fujita, T. p-σ-π analysis. A method for the correlation of biological activity and chemical structure. J. Am. Chem. Soc. 1964, 86, 1616-1626.
• Leo, A.; Hansch, C.; Elkins, D. Partition coefficients and their uses. Chem. Rev. 1971, 71, 525-616.
• Sangster, J. Octanol-water partition coefficients of simple organic compounds. J. Phys. Chem. Ref. Data 1989, 18, 1111-1229.
• Fujita, T.; Iwasa, J.; Hansch, C. A new substituent constant, π, derived from partition coefficients. J. Am. Chem. Soc. 1964, 86, 5175-5180.
• Devoe, H.; Miller, M.M.; Wasik, S.P. Generator columns and high pressure liquid chromatography for determining aqueous solubilities and octanol-water partition coefficients of hydrophobic substances. J. Res. Nat. Bur. Stand. 1981, 86, 361-366.

タイトルに関連する用語 (3件)： 化学 ,  自由エネルギー計算 ,  オクタノール-水分配係数