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J-GLOBAL ID：201902232646614167   整理番号：19A1093758

糖尿病:2型糖尿病のコードバリアントを詳細にマッピングすることで,正しい標的を同定する精度を向上させる

Refining the accuracy of validated target identification through coding variant fine-mapping in type 2 diabetes

著者 (120件)： MAHAJAN Anubha (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  ROBERTSON Neil R. (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  GAN Wei (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  KITAJIMA Hidetoshi (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  RAYNER N. William (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  TAJES Juan Fernandez (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  LINDGREN Cecilia M. (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  MARCHINI Jonathan (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  MORRIS Andrew P. (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  MCCARTHY Mark I. (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  WESSEL Jennifer (Indiana Univ., IN, USA) ,  WILLEMS Sara M. (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  LANGENBERG Claudia (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  WAREHAM Nicholas J. (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  SCOTT Robert A. (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  ZHAO Wei (Univ. Pennsylvania, PA, USA) ,  LEE Jung-Jin (Univ. Pennsylvania, PA, USA) ,  SALEHEEN Danish (Univ. Pennsylvania, PA, USA) ,  HAYWARD Caroline (Univ. Edinburgh, Edinburgh, GBR) ,  NEVILLE Matt (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  OWEN Katharine R. (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  KARPE Fredrik (Univ. Oxford, Oxford, GBR) ,  CHU Audrey Y. (National Heart, Lung, and Blood Inst.’s Framingham Heart Study, MA, USA) ,  DUPUIS Josee (National Heart, Lung, and Blood Inst.’s Framingham Heart Study, MA, USA) ,  CHU Audrey Y. (Brigham and Women’s Hospital, MA, USA) ,  RIDKER Paul M. (Brigham and Women’s Hospital, MA, USA) ,  CHASMAN Daniel I. (Brigham and Women’s Hospital, MA, USA) ,  TALIUN Daniel (Univ. Michigan, MI, USA) ,  TRUBETSKOY Vassily Vladimirovich (Univ. Michigan, MI, USA) ,  TESLOVICH Tanya M. (Univ. Michigan, MI, USA) ,  YAJNIK Pranav (Univ. Michigan, MI, USA) ,  BOEHNKE Michael (Univ. Michigan, MI, USA) ,  RAYNER N. William (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  PRINS Bram Peter (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  HACKINGER Sophie (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  SORANZO Nicole (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  ZEGGINI Eleftheria (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  BARROSO Ines (Wellcome Trust Sanger Inst., Hinxton, GBR) ,  GUO Xiuqing (Harbor-UCLA Medical Center, CA, USA) ,  CHEN Yii-Der Ida (Harbor-UCLA Medical Center, CA, USA) ,  HAI Yang (Harbor-UCLA Medical Center, CA, USA) ,  TAYLOR Kent D. (Harbor-UCLA Medical Center, CA, USA) ,  YAO Jie (Harbor-UCLA Medical Center, CA, USA) ,  ROTTER Jerome I. (Harbor-UCLA Medical Center, CA, USA) ,  LU Yingchang (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, NY, USA) ,  PREUSS Michael (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, NY, USA) ,  BOTTINGER Erwin P. (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, NY, USA) ,  LOOS Ruth J. F. (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, NY, USA) ,  LI Man (Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, MD, USA) ,  SELVIN Elizabeth (Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, MD, USA) ,  LI Man (Univ. Utah School of Medicine, UT, USA) ,  JENSEN Richard A. (Univ. Washington, WA, USA) ,  BRODY Jennifer A. (Univ. Washington, WA, USA) ,  HECKBERT Susan R. (Univ. Washington, WA, USA) ,  PSATY Bruce M. (Univ. Washington, WA, USA) ,  HU Yao (Univ. the Chinese Acad. of Sci., Shanghai, CHN) ,  HUO Shaofeng (Univ. the Chinese Acad. of Sci., Shanghai, CHN) ,  LI Huaixing (Univ. the Chinese Acad. of Sci., Shanghai, CHN) ,  LIN Xu (Univ. the Chinese Acad. of Sci., Shanghai, CHN) ,  LOHMAN Kurt K. (Wake Forest Univ. Health Sci., NC, USA) ,  ZHANG Weihua (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  AFAQ Saima (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  LEHNE Benjamin (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  LOH Marie (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  CHAMBERS John Campbell (Imperial Coll. London, London, GBR) ,  ZHANG Weihua (Ealing Hospital, Middlesex, GBR) ,  CHAMBERS John Campbell (Ealing Hospital, Middlesex, GBR) ,  KOONER Jaspal Singh (Ealing Hospital, Middlesex, GBR) ,  COOK James P. (Univ. Liverpool, Liverpool, GBR) ,  MORRIS Andrew P. (Univ. Liverpool, Liverpool, GBR) ,  FLANNICK Jason (Broad Inst., MA, USA) ,  PELOSO Gina Marie (Broad Inst., MA, USA) ,  BURTT Noeel P. (Broad Inst., MA, USA) ,  KATHIRESAN Sekar (Broad Inst., MA, USA) ,  LINDGREN Cecilia M. (Broad Inst., MA, USA) ,  FLANNICK Jason (Massachusetts General Hospital, MA, USA) ,  GRARUP Niels (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  BORK-JENSEN Jette (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  HANSEN Torben (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  PEDERSEN Oluf (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  KRAVIC Jasmina (Lund Univ. Diabetes Centre, Malmoe, SWE) ,  AHLQVIST Emma (Lund Univ. Diabetes Centre, Malmoe, SWE) ,  ROSENGREN Anders H. (Lund Univ. Diabetes Centre, Malmoe, SWE) ,  GROOP Leif (Lund Univ. Diabetes Centre, Malmoe, SWE) ,  KIM Young Jin (Korea National Inst. of Health, Chungcheongbuk-do, KOR) ,  HAN Sohee (Korea National Inst. of Health, Chungcheongbuk-do, KOR) ,  KIM Bong-Jo (Korea National Inst. of Health, Chungcheongbuk-do, KOR) ,  KIM Sung Soo (Korea National Inst. of Health, Chungcheongbuk-do, KOR) ,  HAN Bok-Ghee (Korea National Inst. of Health, Chungcheongbuk-do, KOR) ,  RYBIN Denis V. (Boston Univ. School of Public Health, MA, USA) ,  PELOSO Gina Marie (Boston Univ. School of Public Health, MA, USA) ,  LIU Ching-Ti (Boston Univ. School of Public Health, MA, USA) ,  DUPUIS Josee (Boston Univ. School of Public Health, MA, USA) ,  YAGHOOTKAR Hanieh (Univ. Exeter, Exeter, GBR) ,  WOOD Andrew R. (Univ. Exeter, Exeter, GBR) ,  FRAYLING Timothy M. (Univ. Exeter, Exeter, GBR) ,  MUELLER-NURASYID Martina (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  STRAUCH Konstantin (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  MUELLER-NURASYID Martina (Ludwig-Maximilians-Univ., Munich, DEU) ,  MUELLER-NURASYID Martina (DZHK (German Centre for Cardiovascular Res.), Munich, DEU) ,  PETERS Annette (DZHK (German Centre for Cardiovascular Res.), Munich, DEU) ,  MEIDTNER Karina (German Inst. of Human Nutrition Potsdam-Rehbruecke (DIfE), Nuthetal, DEU) ,  JAEGER Susanne (German Inst. of Human Nutrition Potsdam-Rehbruecke (DIfE), Nuthetal, DEU) ,  SCHULZE Matthias B. (German Inst. of Human Nutrition Potsdam-Rehbruecke (DIfE), Nuthetal, DEU) ,  MEIDTNER Karina (German Center for Diabetes Res. (DZD), Neuherberg, DEU) ,  JAEGER Susanne (German Center for Diabetes Res. (DZD), Neuherberg, DEU) ,  KRIEBEL Jennifer (German Center for Diabetes Res. (DZD), Neuherberg, DEU) ,  RATHMANN Wolfgang (German Center for Diabetes Res. (DZD), Neuherberg, DEU) ,  THORAND Barbara (German Center for Diabetes Res. (DZD), Neuherberg, DEU) ,  PETERS Annette (German Center for Diabetes Res. (DZD), Neuherberg, DEU) ,  GRALLERT Harald (German Center for Diabetes Res. (DZD), Neuherberg, DEU) ,  SCHULZE Matthias B. (German Center for Diabetes Res. (DZD), Neuherberg, DEU) ,  LI-GAO Ruifang (Leiden Univ. Medical Center, Leiden, NLD) ,  DE HAAN Hugoline G. (Leiden Univ. Medical Center, Leiden, NLD) ,  DE MUTSERT Renee (Leiden Univ. Medical Center, Leiden, NLD) ,  ROSENDAAL Frits R. (Leiden Univ. Medical Center, Leiden, NLD) ,  MOOK-KANAMORI Dennis (Leiden Univ. Medical Center, Leiden, NLD) ,  VARGA Tibor V. (Lund Univ., Malmoe, SWE) ,  FRANKS Paul W. (Lund Univ., Malmoe, SWE) ,  MARTEN Jonathan (Univ. Edinburgh, Edinburgh, GBR)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 50  号： 4  ページ： 559-571  発行年： 2018年04月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文では,さまざまな祖先系統の2型糖尿病症例8万1412例と対照37万832例について,コード領域のバリアントのデータを集めて解析し,40のコードバリアント関連シグナルを同定した(P<2.2×10^-7)。そのうちの16は,既知のリスク関連座位の外側にマッピングされた。これらに関して,2つの重要な観察が得られた。1つは,これらのシグナルの中で低頻度バリアントによるものは5つのみであり,この5つでさえ効果量は中程度(オッズ比≦1.29)しかなかった。もう1つは,大規模なゲノムワイド関連データを用いて,関連バリアントをその局所において詳細にマッピングすると,複雑形質との関連がコード配列全体に豊富に見られるが,コードバリアントが原因であることを示す説得力のある証拠が得られたのは16のシグナルについてだけだった。他の13のシグナルでは,関連コードバリアントは「偽の先導」であることが明らかであり,誤った機構を推定させる可能性があった。コードバリアントとの関連を用いるのは,複雑な疾患についての生物学的な手掛かりを得たり,有効な治療標的を同定したりする際のまさに主流の手法だが,適切な機構を推定するためには,それらのバリアントが原因として疾患の素因に関与することを注意深く特定する必要がある。Copyright Nature Japan KK 2019

シソーラス用語： 座位 ,  *糖尿病 ,  *2型糖尿病
準シソーラス用語： 治療標的 ,  オッズ比 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 糖尿病 ,  2型糖尿病 ,  バリアント ,  マッピング ,  標的 ,  同定