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J-GLOBAL ID：201902232723913590   整理番号：19A0494685

多様性評価のためのシカクマメ(Psophocarpus tetragonolobus(L.)DC.)における遺伝子ベースSSRマーカーの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of Gene-Based SSR Markers in Winged Bean (Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC.) for Diversity Assessment

著者 (14件)： Wong Quin Nee (Biotechnology Research Centre, School of Biosciences, Faculty of Science, University of Nottingham Malaysia Campus, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Tanzi Alberto Stefano (Biotechnology Research Centre, School of Biosciences, Faculty of Science, University of Nottingham Malaysia Campus, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Tanzi Alberto Stefano (Crops For the Future, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Ho Wai Kuan (Biotechnology Research Centre, School of Biosciences, Faculty of Science, University of Nottingham Malaysia Campus, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Ho Wai Kuan (Crops For the Future, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Malla Sunir (Deep Seq, Faculty of Medicine and Health Sciences, Queen’s Medical Centre, University of Nottingham, Nottingham NG7 2UH, UK) ,  Blythe Martin (Deep Seq, Faculty of Medicine and Health Sciences, Queen’s Medical Centre, University of Nottingham, Nottingham NG7 2UH, UK) ,  Karunaratne Asha (Crops For the Future, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Karunaratne Asha (Department of Export Agriculture, Faculty of Agricultural Sciences, Sabaragamuwa University of Sri Lanka, Belihuloya 70140, Sri Lanka) ,  Massawe Festo (Biotechnology Research Centre, School of Biosciences, Faculty of Science, University of Nottingham Malaysia Campus, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Massawe Festo (Crops For the Future, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Mayes Sean (Biotechnology Research Centre, School of Biosciences, Faculty of Science, University of Nottingham Malaysia Campus, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Mayes Sean (Crops For the Future, Jalan Broga, 43500 Semenyih, Selangor Darul Ehsan, Malaysia) ,  Mayes Sean (School of Biosciences, Faculty of Science, University of Nottingham Sutton Bonington Campus, Sutton Bonington, Leicestershire LE12 5RD, UK)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 3  ページ： 100  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ソラマメ(Psophocarpus tetragonolobus)は,パルス,野菜(葉および豆莢)または根塊茎作物のような高温および湿潤国で栽培されている草本多目的マメ科植物である。食品と栄養の安全性に寄与できる異なる栄養素に富む食用部分に加えて,それは持続可能な農業システムの成分として効率的な窒素固定剤である。遺伝資源と改良された系統の発生は,特定の環境に適応した改良栽培品種の不足が,より広い利用を妨げる限界の1つであるので,この作物の育種改善を加速するのに役立つであろう。1462bpのN50を持つ198,554のコンティグから成る,マレーシアの系統からの葉,根,豆莢,生殖組織の4つの組織からトランスクリプトームの新しい集合を構築した。これらのうち,138,958(70.0%)を注釈できた。同定された9682の遺伝子単純配列反復(SSR)モチーフ(単量体反復を除く)の中で,トリヌクレオチド反復が最も豊富であり(4855),次いでジヌクレオチド(4500)反復が続いた。2-および3-ヌクレオチド反復を標的とする合計18のSSRマーカーを,5つの国に由来する9つの遺伝子型の初期評価に基づく多形マーカーとして検証した。クラスタ分析により,この限定されたが多様な生殖質の選択の間の暫定的クラスタを明らかにした。本研究における開発された組立と検証された遺伝子SSRは,ワマメの遺伝的改良のための植物育種システムのより良い理解のための基礎を提供する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 高温 ,  塊茎 ,  クラスタ ,  ソラマメ ,  野菜 ,  遺伝子型 ,  遺伝資源 ,  トランスクリプトーム ,  マレーシア ,  栄養素 ,  *遺伝子 ,  作物育種 ,  生殖 ,  栽培品種
準シソーラス用語： Psophocarpus , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (1件)： Psophocarpus tetragonolobus(L.)DC シカクマメ;SSRマーカー;トランスクリプトーム

分類 (1件)： 豆類  (FC03035U)

引用文献 (40件)：

• NAS. The Winged Bean: High-Protein Crop for the Humid Tropics, 2nd ed.; National Academy Press: Washington, DC, USA, 1981.
• Klu, G.Y.P. Induced mutations for accelerated domestication-a case study of winged bean. West Afr. J. Appl. Ecol. 2000, 1, 47-52.
• Khan, T.N. Papua New Guinea: A centre of genetic diversity in winged bean (Psophocarpus tetragonologus (L.) Dc.). Euphytica 1976, 25, 693-705.
• Harder, D.K. Chromosome Counts in Psophocarpus. Kew Bull. 1992, 47, 529-534.
• Harder, D.K.; Smartt, J. Further evidence on the origin of the cultivated winged bean, Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC. Econ. Bot. 1992, 46, 187-191.

タイトルに関連する用語 (7件)： 多様性 ,  評価 ,  シカクマメ ,  DC ,  遺伝子 ,  SSRマーカー ,  開発