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J-GLOBAL ID：201902233773474756   整理番号：19A1650696

予測された宿主-寄生虫インタラクトームの分析は寄生生活様式と組織親和性に関連する共通性と特異性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Predicted Host-Parasite Interactomes Reveals Commonalities and Specificities Related to Parasitic Lifestyle and Tissues Tropism

著者 (4件)： Cuesta-Astroz Yesid (Instituto Rene Rachou, Fundacao Oswaldo Cruz - FIOCRUZ, Belo Horizonte, Brazil) ,  Santos Alberto (Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark) ,  Oliveira Guilherme (Environmental Genomics, Instituto Tecnologico Vale, Belem, Brazil) ,  Jensen Lars J. (Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 10  ページ： 212  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 宿主系内の寄生虫感染と適応を理解するためには,分子宿主-寄生虫相互作用の研究が不可欠である。同様に,感染症の予防と治療は寄生虫とそれらの宿主の間の分子クロストークの明確な理解を必要とする。しかし,宿主寄生虫分子相互作用の大規模な実験的同定は依然として挑戦的であり,計算予測の使用が必要となっている。ここでは,15の異なる真核生物寄生虫によるヒト感染から生じる宿主寄生虫蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを予測するための計算統合アプローチを提案する。宿主寄生虫系におけるSTRINGデータベースから得られた高信頼性種間相互作用を,対応する種間相同蛋白質対に移動させるために,オーソログに基づくアプローチを用いた。著者らのアプローチは,偽予測の数を減少させるために,それらがそれぞれ単一または多細胞であるかどうかに依存して,寄生虫予測セクレトームおよび膜蛋白質のどちらか,またはセクレトームのみを使用する。さらに,宿主プロテオームは,選択された細胞局在化および寄生虫成長を支持する組織において発現された蛋白質に対して濾過される。著者らは,予測されたネットワークにおける濃縮された生物学的プロセスと経路を分析することによって推論された相互作用を評価し,それらの既知の寄生侵入と回避機構との関連を評価した。得られたPPIネットワークを寄生生物を通して比較し,全体的病原性特徴を定義する共通の機構を同定した。また,ヒトS.mansoniの予測された相互作用のより近い検査に焦点を当てた研究事例を提供し,ヒトS.mansoniネットワークにおいて関連する役割を持つ中心蛋白質を検出し,寄生虫のライフサイクルにおける重要な役割と組織特異的相互作用を同定した。予測したPPIネットワークを可視化し,ダウンロードすることができた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ライフサイクル ,  膜タンパク質 ,  *寄生虫 ,  データベース ,  可視化 ,  ネットワーク ,  プロテオーム ,  ヒト ,  分子間相互作用 ,  寄生虫症 ,  病原性 ,  *予測 ,  真核生物
準シソーラス用語： セクレトーム ,  *特異性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 計算生物学 ,  システム生物学 ,  生物学的ネットワーク ,  寄生虫学 ,  血液疾患 ,  宿主-寄生生物相互作用

分類 (3件)： 微生物感染の生理と病原性  (EG03053T) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  感染免疫  (ED03030P)

引用文献 (93件)：

• WHO. World Health Statistics 2015. Geneva: WHO (2016).
• Adenowo AF, Oyinloye BE, Ogunyinka BI, Kappo AP. Impact of human schistosomiasis in sub-Saharan Africa. Braz J Infect Dis. (2015) 19:196-205. doi: 10.1016/j.bjid.2014.11.004
• Cuesta-Astroz Y, Oliveira FS, de Nahum LA, Oliveira G. Helminth secretomes reflect different lifestyles and parasitized hosts. Int J Parasitol. (2017) 47:529-44. doi: 10.1016/j.ijpara.2017.01.007
• Piña-Vázquez C, Reyes-López M, Ortíz-Estrada G, de la Garza M, Serrano-Luna J. Host-parasite interaction: parasite-derived and -induced proteases that degrade human extracellular matrix. J Parasitol Res. (2012) 2012:748206. doi: 10.1155/2012/748206
• Nelson MM, Jones AR, Carmen JC, Sinai AP, Burchmore R, Wastling JM. Modulation of the host cell proteome by the intracellular apicomplexan parasite Toxoplasma gondii. Infect Immun. (2008) 76:828-44. doi: 10.1128/IAI.01115-07

タイトルに関連する用語 (8件)： 予測 ,  宿主 ,  寄生虫 ,  インタラクトーム ,  分析 ,  寄生 ,  生活様式 ,  特異性