文献

J-GLOBAL ID：201902234254656237   整理番号：19A1495991

マレーシアのパンゴリンの糞便メタゲノミクスはMyrmecophagyへの広範な適応を同定する【JST・京大機械翻訳】

The Fecal Metagenomics of Malayan Pangolins Identifies an Extensive Adaptation to Myrmecophagy

著者 (8件)： Ma Jing-E (Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou, China) ,  Jiang Hai-Ying (Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou, China) ,  Li Lin-Miao (Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou, China) ,  Zhang Xiu-Juan (Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou, China) ,  Li Guan-Yu (Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou, China) ,  Li Hui-Ming (Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou, China) ,  Jin Xue-Jun (Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou, China) ,  Chen Jin-Ping (Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 2793  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 異なる微生物種の数と豊度およびそれらの機能を含む動物の腸におけるフローラの特性は,動物の食餌に密接に関連し,宿主の物理的状態に影響を及ぼす。Malayan pangolin(Manis javanica)は,ミルメカ科において特殊化される絶滅危惧種である。pリンの腸におけるミクロビオームの分析は,この種を保護するために不可欠である。4つのpangolinsの糞便のメタゲノムを配列することによって,1,811のメタゲノム種を表す211,868の遺伝子の非冗長カタログを構築した。分類学的アノテーションはBacteroidetes(49.9%),Proteobacteria(32.2%)およびFirmicutes(12.6%)が3つの主要な門であることを明らかにした。遺伝子機能のアノテーションにより,炭水化物活性酵素データベースにおける88の異なるグリコシドヒドロラーゼ(GH)ファミリーとキチン分解酵素に関連する114遺伝子モジュールからの5044遺伝子を同定し,クラスIIIとVのキチナーゼ遺伝子を含むGH18ファミリー酵素の触媒ドメインに対応した。14の遺伝子モジュールは,クラスI,IIおよびIVのキチナーゼ遺伝子を含むGH19ファミリー酵素の触媒ドメインに対応した。これらの遺伝子は,Bacteroidetes,藍藻類,Firmicutes,およびProteobacteriaの4つの門に属する37種で見つかった。さらに,これらの遺伝子の代謝経路が要約されたとき,41,711の遺伝子は147のユニークなKEGG代謝経路と関連し,これらの遺伝子は2つの遺伝子オントロジー用語,すなわち代謝過程と触媒活性に割り当てられた。著者らはまた,セルロースの消化において役割を果たす可能性があるいくつかの種を見出し,Enterobacter cloacae,Lactococcus lactis,Chitinimonas koreensis,およびChitinophaga pinensisを含むキチンを分解できる可能性がある。加えて,著者らはいくつかの腸のミクロフローラとpangolinsにおける疾患に関連する遺伝子を同定した。27の種は,健康および病的動物において差次的に豊富なSTAMP分析により同定された:CellulosilyticumlentocellumおよびLactobacillus reuteriを含む20種は,健康なpangolinsにおいてより豊富であった。一方,Odoribacter spanchnicus,Marinilabilia salmonicolor,Xanthomonas citri,Xanthomonas bellariivoransおよびClostridium bolteaeを含む7種は,病気のpリンにおいてより豊富であった。これらの結果は,pangolinsを保存する努力を支持する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ミクロフローラ ,  Clostridium ,  代謝経路 ,  キチナーゼ ,  動物 ,  フローラ ,  キチン ,  代謝 ,  アノテーション ,  *遺伝子
準シソーラス用語： Firmicutes ,  プロテオバクテリア ,  バクテロイデス門 ,  メタゲノム ,  *メタゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Myrmecophagy ,  キチン分解酵素 ,  救助 ,  腸内細菌叢 ,  セルロース消化

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

引用文献 (68件)：

• Anand A. A., Vennison S. J., Sankar S. G., Prabhu D. I., Vasan P. T., Raghuraman T., et al. (2010). Isolation and characterization of bacteria from the gut of Bombyx mori that degrade cellulose, xylan, pectin and starch and their impact on digestion. J. Insect Sci. 10:107. doi: 10.1673/031.010.10701
• Angelakis E., Yasir M., Bachar D., Azhar E. I., Lagier J. C., Bibi F., et al. (2016). Gut microbiome and dietary patterns in different Saudi populations and monkeys. Sci. Rep. 6:32191. doi: 10.1038/srep32191
• Antony R., Krishnan K. P., Thomas S., Abraham W. P., Thamban M. (2009). Phenotypic and molecular identification of Cellulosimicrobium cellulans isolated from Antarctic snow. Antonie Van Leeuwenhoek 96, 627-634. doi: 10.1007/s10482-009-9377-9
• Arora P. K., Jain R. K. (2013). Arthrobacter nitrophenolicus sp. nov . a new 2-chloro-4-nitrophenol degrading bacterium isolated from contaminated soil. Biotech 3, 29-32. doi: 10.1007/s13205-012-0066-4
• Bakalidou A., Kampfer P., Berchtold M., Kuhnigk T., Wenzel M., Konig H. (2002). Cellulosimicrobium variabile sp. nov., a cellulolytic bacterium from the hindgut of the termite Mastotermes darwiniensis. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52, 1185-1192. doi: 10.1099/00207713-52-4-1185

タイトルに関連する用語 (5件)： マレーシア ,  糞便 ,  メタゲノミクス ,  適応 ,  同定