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J-GLOBAL ID：201902234289119529   整理番号：19A1948615

種多様性と推定機能能力を同定するカカオ豆発酵ミクロビオームのメタゲノミクス分析【JST・京大機械翻訳】

Metagenomics analysis of cocoa bean fermentation microbiome identifying species diversity and putative functional capabilities

著者 (10件)： Agyirifo Daniel S. (Biochemistry and Biotechnology Department, Kenyatta University, Kenya) ,  Agyirifo Daniel S. (Department of Molecular Biology and Biotechnology, University of Cape Coast, Ghana) ,  Wamalwa Mark (Biochemistry and Biotechnology Department, Kenyatta University, Kenya) ,  Wamalwa Mark (International Livestock Research Institute-Bioscience East and Central Africa, Kenya) ,  Otwe Emmanuel Plas (Department of Molecular Biology and Biotechnology, University of Cape Coast, Ghana) ,  Galyuon Isaac (Department of Molecular Biology and Biotechnology, University of Cape Coast, Ghana) ,  Runo Steven (Biochemistry and Biotechnology Department, Kenyatta University, Kenya) ,  Takrama Jemmy (Department of Molecular Biology and Biotechnology, University of Cape Coast, Ghana) ,  Takrama Jemmy (Cocoa Research Institute of Ghana, Ghana) ,  Ngeranwa Joseph (Biochemistry and Biotechnology Department, Kenyatta University, Kenya)
資料名： Heliyon  (Heliyon)
巻： 5  号： 7  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3098A  ISSN： 2405-8440  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Theobroma cacao L.豆の発酵はチョコレートおよびその誘導体のようなココア製品の生産における最も重要な段階である。カカオ豆発酵中の微生物多様性の複雑な応答についての理解は限られている。本研究の目的は,微生物多様性,構造,機能的アノテーション,および代謝経路のマッピングを解明するために,培養非依存性アプローチを用いてカカオ豆発酵ヒープにおける微生物群集を調べることであった。ゲノムDNAをココア豆発酵ヒープの試料から抽出し,精製し,ライブラリー調製した。配列データは,Illina Hiseq 2000 paired-end技術(Macrogen Inc)上で生成された。メタゲノムから予測された遺伝子に基づく分類学的分析により,カカオ微生物由来の細菌(90.0%),酵母(9%),バクテリオファージ(1%)の高い割合が同定された。Lactobacillus(20%),Gluconacetobacter(9%),Acetobacter(7%)およびGluconobacter(6%)が本研究を支配した。Shannonα-多様性指数によって測定された平均種多様性は142.81と推定された。97%配列類似性におけるSEEDデータベースカテゴリーへのメタゲノム配列の帰属は,炭水化物と芳香族アミノ酸の従属栄養乳酸発酵の遺伝的プロファイル特性を同定した。芳香族化合物,アミノ酸およびそれらの誘導体および炭水化物の代謝は,それぞれ0.6%,8%および13%を占めた。全体として,これらの結果はココア微生物に対する洞察を提供し,フレーバー及び芳香生産に必要なフェニルアセトアルデヒド,ブタンジオール,アセトイン及びテオブロミンのような芳香族化合物をコードする複雑な微生物群集及び代謝経路により広く行われる発酵プロセスを同定した。得られた結果は,良好な芳香及びフレーバー化合物形成のための微生物の選択のための望ましいチョコレートフレーバー又は標的代謝経路を生産するための標的接種の開発を助けるであろう。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 微生物 ,  芳香族化合物 ,  アミノ酸 ,  酵母 ,  酢酸菌属 ,  接種 ,  培養 ,  *生物多様性 ,  乳酸桿菌属 ,  代謝経路 ,  ココア ,  遺伝子 ,  *発酵
準シソーラス用語： メタゲノム ,  微生物多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： バイオインフォマティクス ,  バイオテクノロジー ,  微生物 ,  分子生物学

分類 (1件)： 歯の基礎医学  (GT01020O)

タイトルに関連する用語 (9件)： 種多様性 ,  推定 ,  能力 ,  同定 ,  カカオ豆 ,  発酵 ,  ミクロビオーム ,  メタゲノミクス ,  分析