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J-GLOBAL ID：201902235604710834   整理番号：19A1636617

森林生態系修復中の土壌メタゲノム内の微生物機能遺伝子の変化【JST・京大機械翻訳】

Changes in microbial functional genes within the soil metagenome during forest ecosystem restoration

著者 (2件)： Sun Shan (School of Plant and Environmental Sciences, Virginia Tech, Blacksburg, VA, 24060, USA) ,  Badgley Brian D. (School of Plant and Environmental Sciences, Virginia Tech, Blacksburg, VA, 24060, USA)
資料名： Soil Biology & Biochemistry  (Soil Biology & Biochemistry)
巻： 135  ページ： 163-172  発行年： 2019年 
JST資料番号： D0628A  ISSN： 0038-0717  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの生態学的プロセスの重要なメディエーターとして,土壌微生物は撹乱後の生態系の回復において重要な役割を果たしている。次世代シークエンシング技術を用いて,生態系回復中の微生物分類学的変化は広く研究されているが,微生物群集構造のみを記述するデータは微生物により仲介される生態系過程にリンクすることは困難である。ショットガンメタゲノム配列決定は,微生物群集の回復と生態学的機能の間の数千の機能的遺伝子の変化を調べる機会を提供する。著者らは,6~31年にわたる鉱山土壌の時系列から15の土壌メタゲノムを分析した。分類学的および機能的変化は,銅栄養から貧栄養グループへのシフト,難分解性炭素源の代謝の増加,および植生の影響を示す。転移性要素,病原性,防御およびストレス応答に関与する遺伝子の増加は,クロノシーケンス年齢を持つ微生物間のより協調的で競争的な相互作用を示唆する。N循環群の中で,アンモニアと亜硝酸塩酸化細菌は回復中に有意に増加したが,重要なN-サイクル機能遺伝子において有意な変化はほとんど観察されなかった。すべての森林土壌におけるメタン資化菌とメタンモノオキシゲナーゼ遺伝子の低い相対存在量は,メタン消費が再植林後31年でこれらのサイトで回復しなかったという以前の観察を説明する。本研究は,土壌微生物を生態系回復に結びつける可能な機構を同定し,N循環と温室効果ガス放出に焦点を当て,生態系機能の回復における土壌微生物の役割をより良く理解することを助ける。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 森林土 ,  資化 ,  銅 ,  生態学 ,  アンモニア ,  酸化 ,  *微生物 ,  *生態系 ,  細菌 ,  土壌微生物 ,  相互作用 ,  アルカン
準シソーラス用語： 炭素源 ,  微生物コンソーシアム ,  *メタゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 微生物群集 ,  メタゲノム ,  微生物機能遺伝子 ,  森林生態系回復

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

物質索引 (1件)： メタン

タイトルに関連する用語 (6件)： 森林生態系 ,  修復 ,  土壌 ,  メタゲノム ,  微生物 ,  機能遺伝子