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J-GLOBAL ID：201902237464108330   整理番号：19A1884256

アロステリック蛋白質S100A12の配位子結合折畳み/二量化動力学に対するエネルギーフラストレーションの影響【JST・京大機械翻訳】

Consequences of Energetic Frustration on the Ligand-Coupled Folding/Dimerization Dynamics of Allosteric Protein S100A12

著者 (5件)： Ren Weitong (National Laboratory of Solid State Microstructure, Department of Physics, and Collaborative Innovation Center of Advanced Microstructures, Nanjing University, China) ,  Li Wenfei (National Laboratory of Solid State Microstructure, Department of Physics, and Collaborative Innovation Center of Advanced Microstructures, Nanjing University, China) ,  Wang Jun (National Laboratory of Solid State Microstructure, Department of Physics, and Collaborative Innovation Center of Advanced Microstructures, Nanjing University, China) ,  Zhang Jian (National Laboratory of Solid State Microstructure, Department of Physics, and Collaborative Innovation Center of Advanced Microstructures, Nanjing University, China) ,  Wang Wei (National Laboratory of Solid State Microstructure, Department of Physics, and Collaborative Innovation Center of Advanced Microstructures, Nanjing University, China)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 121  号： 42  ページ： 9799-9806  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： アロステリック蛋白質は,機能的に関連する二つの立体配座のエネルギー的縮退により特徴付けられるので,それらのエネルギー景観はしばしば局所的にフラストレーションされる。このようなフラストレーションが蛋白質折畳み/結合動力学にどのように影響するかは良く理解されていない。ここでは,分子シミュレーションを用い,ホモ二量体蛋白質S100A12に基づくアロステリック蛋白質の二量体化動力学における局所フラストレーションの結果を検討した。三次元構造における二つのEFハンドモチーフの構造的対称性にもかかわらず,S100A12ホモ二量体はアロステリック挙動を示し,その構造要素の半分,すなわちC末端EFハンドにおいてのみ局所的フラストレーションを示した。このフラストレーションの空間的に非対称な位置が非対称二量化経路をもたらし,その中で二量化が最小限にフラストレートしたN末端EFハンドの鎖間結合により優先的に開始され,エネルギー景観への迅速な立体配座スイッチングと鎖間集合の必要条件の間の最適バランスを達成することを示した。また,エネルギー景観の二重盆地地形により代表される局所フラストレーションは,二量化がC末端EFハンドのアロステリック運動と結合する多重架橋二量化経路を生じることを示した。金属イオンの結合はエネルギー景観を再構成し,二量化経路を調節する傾向がある。加えて,フラストレーション計法を用いることにより,C末端EFハンドにおける高度にフラストレートされた残基対が天然ホモ二量体の立体配座転移時に部分的に非折畳みされ,自由エネルギー障壁の低下をもたらすことを示した。著者らの結果は,エネルギー景観の局所的フラストレーションとアロステリック蛋白質の二量化動力学の間の密接な相互作用を明らかにした。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 金属イオン ,  自由エネルギー ,  非対称性 ,  必要条件 ,  配座転移 ,  立体配座 ,  再構成 ,  *タンパク質 ,  スイッチング ,  相互作用 ,  *二量化 ,  縮退 ,  *折畳み
準シソーラス用語： C末端 ,  *S100A12 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： 蛋白質 ,  S100A12 ,  配位子 ,  折畳み ,  二量化 ,  動力学 ,  エネルギー ,  フラストレーション