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J-GLOBAL ID：201902238250578432   整理番号：19A1708855

心臓のグリコシドストレスに対する大型トウワタ(Oncopeltus fasciatus)における発現研究のためのロバストな参照遺伝子設計と検証【JST・京大機械翻訳】

Robust reference gene design and validation for expression studies in the large milkweed bug, Oncopeltus fasciatus, upon cardiac glycoside stress

著者 (4件)： Meinzer Fee (Molekulare Evolutionsbiologie, Institut fuer Zoologie, Universitaet Hamburg, Martin-Luther-King Platz 3, 20146 Hamburg, Germany) ,  Dobler Susanne (Molekulare Evolutionsbiologie, Institut fuer Zoologie, Universitaet Hamburg, Martin-Luther-King Platz 3, 20146 Hamburg, Germany) ,  Donath Alexander (Zentrum fuer Molekulare Biodiversitaetsforschung, Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig, 53113 Bonn, Germany) ,  Lohr Jennifer N. (Molekulare Evolutionsbiologie, Institut fuer Zoologie, Universitaet Hamburg, Martin-Luther-King Platz 3, 20146 Hamburg, Germany)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 710  ページ： 66-75  発行年： 2019年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 発達および進化モデル生物としての歴史にもかかわらず,大規模なミクサ,Oncopeltus筋膜における遺伝子発現分析は,定量的リアルタイムPCRを用いてほとんど研究されていない。この方法の強度は正規化のために用いられる内因性対照に大きく依存し,それはミルク雑草バグシステムに対して欠けている。ここでは,著者らの知識におけるこのギャップを埋めるために,O.fasciatusトランスクリプトームから同定された10の候補参照遺伝子のセットの安定性を検証し,食事性毒素,心臓グリコシド,および4つの異なる曝露期間を通して曝露した。gDNA汚染物質に対するロバスト性を増加させるために,ゲノム資源を用いて,イントロン架橋プライマーを設計した。BestKeeper,Normfinder,geNorm及び比較ΔCt法による包括的安定性検証は,処理及び時間点を通して最も安定な遺伝子としてef1a及びチューブリンを同定したが,18S rRNAは最も不安定であった。しかし,時間スケールを考慮することは,時間点拘束正規化器が処理比較のためのより高い定量化精度を可能にすることを示した。全体として本研究は実証した。(i)ゲノムアノテーションがしばしば不完全な非モデル生物に対してロバストなRT-qPCRプライマー設計アプローチが可能であり,(ii)多因子実験計画における詳細な参照遺伝子安定性探索の重要性がある。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *グリコシド ,  チューブリン ,  *ロバスト性 ,  雑草 ,  *遺伝子 ,  正規化 ,  遺伝子発現 ,  牛乳 ,  定量的PCR法 ,  *心臓 ,  毒素 ,  イントロン
準シソーラス用語： 内因性 ,  *Oncopeltus ,  *参照遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 定量的リアルタイムPCR ,  遺伝子発現 ,  Oncopeltus fasciatus ,  参照遺伝子 ,  ウアベイン

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (10件)： 心臓 ,  大型 ,  トウ ,  ワタ ,  発現 ,  研究 ,  ロバスト ,  参照遺伝子 ,  設計 ,  検証