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J-GLOBAL ID：201902238300110171   整理番号：19A0494056

低温耐性に関与する遺伝子とシグナル伝達経路を同定するためのPassiflora edulis SIMSにおけるde novoトランスクリプトーム配列決定【JST・京大機械翻訳】

De Novo Transcriptome Sequencing in Passiflora edulis Sims to Identify Genes and Signaling Pathways Involved in Cold Tolerance

著者 (10件)： Liu Sian (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Liu Sian (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Li Anding (Institute of Mountain Resources, Guizhou Academy of Science, Guiyang 550001, China) ,  Chen Caihui (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Chen Caihui (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Cai Guojun (Institute of Mountain Resources, Guizhou Academy of Science, Guiyang 550001, China) ,  Zhang Limin (Institute of Mountain Resources, Guizhou Academy of Science, Guiyang 550001, China) ,  Guo Chunyan (Guizhou Botanical Garden, Guizhou Academy of Science, Guiyang 550001, China) ,  Xu Meng (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Xu Meng (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China)
資料名： Forests (Web)  (Forests (Web))
巻： 8  号： 11  ページ： 435  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7188A  ISSN： 1999-4907  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： パッションフルーツ(Passiflora edulis Sims)は,紫色のグラナジラとして知られており,中国南部を通して果実市場の新しいDarlingとして広く栽培されている。この外来および多年生気候は温暖で湿潤な気候に適応し,一般的に寒冷には不耐性である。この種の寒冷ストレス応答に関連する遺伝子調節とシグナル伝達経路に関する情報は限られている。本研究において,2つのトランスクリプトームライブラリー(Kedu_AP対GX_AP)を,それぞれP.edulisの耐寒性および低温感受性品種の空中部分から構築した。全体として,126,284,018のクリーンリードを得て,1449bpの平均サイズを有する86,880の単一遺伝子を組み立てた。これらのうち,公的に利用可能な植物蛋白質配列と有意な類似性を有する64,067(73.74%)の単一遺伝子があった。発現プロファイルが発生し,3045の遺伝子がKedu_APとGX_APライブラリーの間で有意に差別的に発現され,1075(35.3%)が上方制御され,1970(64.7%)がダウンレギュレーションされた。これらは植物ホルモンシグナル伝達の豊富な経路における36の遺伝子と推定転写因子をコードする56の遺伝子を含んでいた。ICE1-CBF-COR経路に関与する6つの遺伝子を耐寒性品種で誘導し,それらの発現レベルを定量的リアルタイムPCRを用いてさらに検証した。本報告は,P.edulisにおけるハイスループットトランスクリプトーム配列決定を用いて耐寒性に関与する遺伝子とシグナル伝達経路を同定する最初のものである。これらの知見は,Passiflora種における耐寒性および遺伝的育種を調節する分子機構に対する有用な洞察を提供する可能性がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  遺伝的調節 ,  転写因子 ,  耐寒性 ,  育種 ,  寒冷ストレス ,  *パッションフルーツ ,  アミノ酸配列 ,  植物ホルモン ,  *トランスクリプトーム ,  品種 ,  *遺伝子 ,  *細胞情報伝達 ,  ダウンレギュレーション
準シソーラス用語： Passiflora , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： パッションフルーツ ,  耐寒性 ,  RNAシークエンシング ,  DEG ,  ICE1-CBF-COR

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (52件)：

• Rodriguez, R.R.; Dallas, M.P. Aislamientoy cultivo de protoplastos enmaracuyá isolation and cultive of protoplast in passion fruit. Acta Biol. Colomb. 2004, 9, 35-46.
• Benincá, J.P.; Montanher, A.B.; Zucolotto, S.M.; Schenkel, E.P.; Fröde, T.S. Evaluation of the anti-inflammatory efficacy of Passiflora edulis. Food Chem. 2007, 104, 1097-1105.
• Bernacci, L.C.; Soares-Scott, M.D.; Junqueira, N.T.V.; Passos, I.R.D.S.; Meletti, L.M.M. Passiflora edulis sims the correct taxonomic way to cite the yellow passionfruit (and of others colors). Rev. Bras. Frutic. 2008, 30, 566-576.
• Rudnicki, M.; de Oliveira, M.R.; Veiga Pereira, T.d.; Reginatto, F.H.; Dal-Pizzol, F.; Fonseca Moreira, J.C. Antioxidant and antiglycation properties of Passiflora alata and Passiflora edulis extracts. Food Chem. 2007, 100, 719-724.
• Benigni, R.; Capra, C.; Cattorini, P. Plante medicinale; chimica, farmacologia e terapia. Milan Inverni Della Beffa 1962, 2, 1012-1022.

タイトルに関連する用語 (7件)： 低温耐性 ,  遺伝子 ,  シグナル伝達経路 ,  同定 ,  Passiflora ,  SIMS ,  トランスクリプトーム