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J-GLOBAL ID：201902239202808639   整理番号：19A2147327

敗血症患者の骨格筋細胞遺伝子マーカーの特徴分析【JST・京大機械翻訳】

Characteristic bioanalysis of skeletal muscle cells gene markers in septic patients

著者 (6件)： Tian Kuo (哈爾浜医科大学附属第二医院卒中中心,黒竜江哈爾浜,150001) ,  Wang Jianjian (哈爾浜医科大学附属第二医院卒中中心,黒竜江哈爾浜,150001) ,  Liu Peifang (哈爾浜医科大学附属第二医院卒中中心,黒竜江哈爾浜,150001) ,  Zhang Huixue (哈爾浜医科大学附属第二医院卒中中心,黒竜江哈爾浜,150001) ,  Lu Xiaoyu (哈爾浜医科大学附属第二医院卒中中心,黒竜江哈爾浜,150001) ,  Xu Chen (哈爾浜医科大学附属第二医院卒中中心,黒竜江哈爾浜,150001)
資料名： Zhonghua Weizhongbing Jijiu Yixue  (Zhonghua Weizhongbing Jijiu Yixue)
号： 3  ページ： 293-297  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2241A  ISSN： 2095-4352  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:バイオインフォマティクス法を用いて敗血症患者の骨格筋細胞遺伝子マーカーの特徴を分析する。方法:米国国立バイオテクノロジー情報センター(NCBI)の遺伝子発現データベース(GEO)から、敗血症患者の骨格筋繊維組織遺伝子チップ発現データセット(GSE13205)を獲得した。NCBIWebサイトによって提供されたオンラインR言語分析ツール(GEO2R)を用いて、遺伝子差異発現分析を行い、オンライン生物情報コホート研究ツール(BART)と米国国家ネットワーク生物学資源プロジェクトソフトウェアCytoscpeを用いてデータ処理、分析、マッピングを行った。DAVID遺伝子データベース中の京都遺伝子とゲノム百科全書(KEGG)経路濃縮方法及び遺伝子オントロジー(GO)機能濃縮法を用いて、差次的発現遺伝子に対してオンライン経路濃縮分析とGO機能分析を行った。さらに,遺伝子と蛋白質相互作用検索データベース(STRING-DB)を用いて,遺伝子データセットに関する蛋白質相互作用を分析した。【結果】GSE13205のデータセットから250の遺伝子(TOP250)を抽出し,合計242つの差次的発現遺伝子を,78の上方制御遺伝子と164のダウンレギュレーション遺伝子を含む遺伝子に組み入れた。これらの差次的発現遺伝子は、異なる生物学的過程や分子機能のサブ集中に濃縮され、その中、生物学的過程は主に成長の正負の制御とミネラルの吸収などの経路に濃縮される。蛋白質相互作用ネットワーク図において、14個の最も密接に関連する差次的発現遺伝子を同定した。結論:敗血症患者の差次的発現遺伝子は、主に細胞成長のアポトーシスを制御し、腫瘍関連免疫機能異常を媒介する自己調節などに集中している。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ダウンレギュレーション ,  ネットワーク ,  データベース ,  アポトーシス ,  機能分析 ,  *遺伝子 ,  *ヒト ,  腫瘍 ,  細胞増殖 ,  *敗血症 ,  *骨格筋 ,  アップレギュレーション ,  *細菌感染症
準シソーラス用語： 差次的遺伝子発現 ,  遺伝子オントロジー ,  オンライン ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Sepsis ,  Gene chip ,  Bioinformatics ,  Biomarker

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  応急処置  (GC03014I)

タイトルに関連する用語 (5件)： 敗血症 ,  患者 ,  骨格筋細胞 ,  遺伝子マーカー ,  特徴分析