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J-GLOBAL ID：201902239469582905   整理番号：19A1883660

グラフェンおよびヒドロキシル化誘導体上のアラニンジペプチド立体配座平衡の決定因子【JST・京大機械翻訳】

Determinants of Alanine Dipeptide Conformational Equilibria on Graphene and Hydroxylated Derivatives

著者 (3件)： Poblete Horacio (Institute of Computational Comparative Medicine, Nanotechnology Innovation Center of Kansas State, Department of Anatomy and Physiology, Kansas State University, Kansas, United States) ,  Miranda-Carvajal Ingrid (Universidad Nacional de Colombia, Departamento de Quimica, Colombia) ,  Comer Jeffrey (Institute of Computational Comparative Medicine, Nanotechnology Innovation Center of Kansas State, Department of Anatomy and Physiology, Kansas State University, Kansas, United States)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 121  号： 15  ページ： 3895-3907  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 炭素ナノ材料と蛋白質との相互作用を理解することは,これらの材料の健康への潜在的影響を決定し,それらに基づくバイオテクノロジーの設計において不可欠である。ここでは,炭素ナノ材料表面への吸着が蛋白質骨格構造の広く用いられているモデルであるアラニンジペプチドの立体配座平衡にどのように影響するかを調べるために,明確な溶媒分子シミュレーションと多次元自由エネルギー計算を行った。グラフェン(または大きなカーボンナノチューブ)上のアラニンジペプチドの2つの最も好ましい構造は,同じ平面にある2つのアミド結合に対応し,水溶液中で優勢な非平面αヘリックス様およびβシート様立体配座よりも表面に対して平坦であることを見出した。グラフェン表面では,後者の立体配座は準安定で,N末端アミドのアミド-πスタッキングに最もよく対応する。計算は,立体配座平衡の決定におけるアミド-π相互作用の重要な役割を強調した。低いが,高密度界面水層への水素結合又はヒドロキシル化グラフェンのヒドロキシル基への顕著な寄与も,最も好ましい立体配座を定義した。本研究は,蛋白質構造に及ぼすカーボンナノチューブ,グラフェンおよびそれらの官能化誘導体の影響に関する洞察をもたらすはずである。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 界面 ,  *ヒドロキシ化 ,  *立体配座 ,  ヒドロキシ基 ,  計算機シミュレーション ,  官能化 ,  水素結合 ,  *グラフェン ,  β構造 ,  *ジペプチド ,  カーボンナノチューブ ,  タンパク質 ,  *配座平衡 ,  相互作用 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： αヘリックス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

物質索引 (1件)： アラニン

タイトルに関連する用語 (6件)： グラフェン ,  ヒドロキシル化 ,  誘導体 ,  アラニンジペプチド ,  立体配座平衡 ,  決定因子