文献

J-GLOBAL ID：201902239796605075   整理番号：19A0040474

コムギにおける2つの主要核小体オーガナイザー領域(NORs),NOR-B1およびNOR-B2,および染色体特異的rRNA遺伝子発現の構造的特徴【JST・京大機械翻訳】

Structural features of two major nucleolar organizer regions (NORs), Nor-B1 and Nor-B2, and chromosome-specific rRNA gene expression in wheat

著者 (13件)： Handa Hirokazu (Institute of Crop Science, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), Tsukuba, 305-8518, Japan) ,  Kanamori Hiroyuki (Institute of Crop Science, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), Tsukuba, 305-8518, Japan) ,  Tanaka Tsuyoshi (Institute of Crop Science, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), Tsukuba, 305-8518, Japan) ,  Murata Kazuki (Laboratory of Plant Genetics, Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kyoto, 606-8502, Japan) ,  Kobayashi Fuminori (Institute of Crop Science, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), Tsukuba, 305-8518, Japan) ,  Robinson Stephen J. (Saskatoon Research and Development Centre, Agriculture and Agri-Food Canada, Saskatoon, SK, S7N 0X2, Canada) ,  Koh Chu S. (Global Institute for Food Security, University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, S7N 4J8, Canada) ,  Pozniak Curtis J. (Crop Development Centre, University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, S7N 5A8, Canada) ,  Sharpe Andrew G. (Global Institute for Food Security, University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, S7N 4J8, Canada) ,  Paux Etienne (GDEC, INRA, Universite Clermont Auvergne, 63000, Clermont-Ferrand, France) ,  International Wheat Genome Sequencing Consortium (IWGSC, 2841 NE Marywood Ct, Lee’s Summit, MO, 64086, USA) ,  Wu Jianzhong (Institute of Crop Science, National Agriculture and Food Research Organization (NARO), Tsukuba, 305-8518, Japan) ,  Nasuda Shuhei (Laboratory of Plant Genetics, Graduate School of Agriculture, Kyoto University, Kyoto, 606-8502, Japan)
資料名： Plant Journal  (Plant Journal)
巻： 96  号： 6  ページ： 1148-1159  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1374A  ISSN： 0960-7412  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コムギ「中国春」(CS)の参照ゲノム配列は現在利用可能(IWGSC RefSeqv1.0)であるが,核小体オーガナイザー領域(NORs)を定義するコア配列は特性化されていない。コムギのゲノムにおけるrDNAユニットの総コピー数は11160であり,その中で30.5%,60.9%および8.6%がそれぞれNorB-B1(1B),NorB-B2(6B)および他のNORsに位置していると推定した。NORsの全長は100Mbと推定され,RefSeqv1.0では表現されないゲノムの非集合部分の約10%に相当する。rDNAユニットの4つのサブタイプ(S1-S4)を,NorB-B1とNorB-B2における3′外部転写スペーサー領域内の差異に基づいて同定し,定量的PCRはrDNAサブタイプ含量における位置特異的変異を示した。rDNAサブタイプの発現分析は,コムギゲノムにおけるrDNAサブタイプの相対的存在量と対照的に,S1が主に発現し,S2が弱く発現することを明らかにした。これらの結果は,配列差に基づく異なるrDNA発現の調節機構を示唆する。S3発現は,Dt1BLとDt6BLにおいて増加し,S3が染色体仲介サイレンシングを受けることを示唆した。グループ1と6の相同染色体間のNORを囲む領域で構造的差異が検出された。主要なNORsに近い隣接領域は,それらの同種の対応物と比較して拡大し,これらの拡大領域の遺伝子密度は比較的低かった。著者らは,これらの領域が関連する主要なNORsの自己調節およびマイナーなNORsのサイレンシングに対して重要である可能性があるという証拠を提供する。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： コピー数 ,  *rRNA ,  変異 ,  *遺伝子発現 ,  定量的PCR法 ,  ゲノム ,  春 ,  *コムギ ,  キャラクタリゼーション ,  遺伝子サイレンシング
準シソーラス用語： スペーサー領域 ,  サブタイプ ,  リボソームDNA ,  ゲノム配列 ,  *オーガナイザー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 核小体形成領域 ,  rDNA単位サブタイプ ,  核小体優位性 ,  遺伝子発現 ,  シーケンス構造 ,  Triticum aestivum L.

分類 (1件)： 植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： コムギ ,  染色体 ,  rRNA遺伝子 ,  発現 ,  構造的特徴