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J-GLOBAL ID：201902239982732067   整理番号：19A0494559

NNV感染に対する応答におけるsevenband grouper(Hyporthodus septemasciatus)における脳組織のトランスクリプトームおよび遺伝子発現の特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterization of the Transcriptome and Gene Expression of Brain Tissue in Sevenband Grouper (Hyporthodus septemfasciatus) in Response to NNV Infection

著者 (4件)： Kim Jong-Oh (Department of Aqualife Medicine, College of Fisheries and Ocean Science, Chonnam National University, Yeosu 550-749, Korea) ,  Kim Jae-Ok (Department of Aqualife Medicine, College of Fisheries and Ocean Science, Chonnam National University, Yeosu 550-749, Korea) ,  Kim Wi-Sik (Department of Aqualife Medicine, College of Fisheries and Ocean Science, Chonnam National University, Yeosu 550-749, Korea) ,  Oh Myung-Joo (Department of Aqualife Medicine, College of Fisheries and Ocean Science, Chonnam National University, Yeosu 550-749, Korea)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 31  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ハタは東南アジアにおける好ましい海産食品資源の1つである。しかしながら,神経壊死ウイルス(NNV)感染によるウイルス性神経壊死(VNN)疾患の発生は,ハタ幼虫の大量死亡を引き起こした。多くの養殖場はVNNの発生により実質的な財政的損失を受けている。NNVの感染機構をより良く理解するために,著者らはNNV感染の主な標的である7バンドハタ脳組織のトランスクリプトーム解析を行った。人工的NNVチャレンジの後,7バンドハタの脳組織のトランスクリプトームを,Illina Hi-seq2500システムを用いて次世代シークエンシング(NGS)にかけた。モックのプールされたサンプルからのmRNAとNNV感染された7バンドハタ脳の両方が配列された。mockとNNV感染試料のクリーンな読み取りをde novoで組み立て,104,348の単一遺伝子を得た。加えて,NNV感染に反応した628の差別的に発現した遺伝子(DEG)を同定した。この結果は,NNV感染に関与する遺伝子の同定だけでなく,NNV感染に対する7バンドハタの応答の理解のために重要な情報を提供することができた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 死 ,  幼虫 ,  *遺伝子 ,  壊死 ,  養殖場 ,  *キャラクタリゼーション ,  *遺伝子発現 ,  東南アジア ,  mRNA ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 次世代シークエンシング ,  トランスクリプトーム解析 ,  神経 ,  海産物 ,  *脳組織 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 神経壊死ウイルス(NNV) ,  Sevenbandグループ ,  トランスクリプトーム ,  次世代シークエンシング(NGS) ,  異なる発現遺伝子(DEGS)

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R)

引用文献 (58件)：

• Kim, C.S.; Kim, W.S.; Nishizawa, T.; Oh, M.J. Prevalence of viral nervous necrosis (VNN) in sevenband grouper, Epinephelus septemfasciatus farms. J. Fish Pathol. 2012, 25, 111-116.
• Munday, B.L.; Kwang, J.; Moody, N. Betanodavirus infections of teleost fish: A review. J. Fish Dis. 2002, 25, 127-142.
• Munday, B.L.; Nakai, T. Special topic review: Nodaviruses as pathogens in larval and juvenile marine finfish. World J. Microbiol. Biotechnol. 1997, 13, 375-381.
• Muroga, K. Viral and bacterial diseases of marine fish and shellfish in Japanese hatcheries. Aquaculture 2001, 202, 23-44.
• Cha, S.J.; Do, J.W.; Lee, N.S.; An, E.J.; Kim, Y.C.; Kim, J.W.; Park, J.W. Phylogenetic analysis of betanodaviruses isolated from cultured fish in Korea. Dis. Aquat. Org. 2007, 77, 181-189.

タイトルに関連する用語 (6件)： 感染 ,  応答 ,  脳組織 ,  トランスクリプトーム ,  遺伝子発現 ,  特性化