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J-GLOBAL ID：201902241259619715   整理番号：19A1291653

ミューオピオイド受容体におけるフェンタニルファミリー:結合と計算解析の均一評価【JST・京大機械翻訳】

Fentanyl Family at the Mu-Opioid Receptor: Uniform Assessment of Binding and Computational Analysis

著者 (11件)： Lipinski Piotr F. J. (Department of Neuropeptides, Mossakowski Medical Research Centre, Polish Academy of Sciences, 02-106 Warsaw, Poland) ,  Kosson Piotr (Toxicology Research Laboratory, Mossakowski Medical Research Centre, Polish Academy of Sciences, 02-106 Warsaw, Poland) ,  Matalinska Joanna (Department of Neuropeptides, Mossakowski Medical Research Centre, Polish Academy of Sciences, 02-106 Warsaw, Poland) ,  Roszkowski Piotr (Faculty of Chemistry, University of Warsaw, 02-093 Warsaw, Poland) ,  Czarnocki Zbigniew (Faculty of Chemistry, University of Warsaw, 02-093 Warsaw, Poland) ,  Jaronczyk Malgorzata (National Medicines Institute, 00-725 Warsaw, Poland) ,  Misicka Aleksandra (Department of Neuropeptides, Mossakowski Medical Research Centre, Polish Academy of Sciences, 02-106 Warsaw, Poland) ,  Misicka Aleksandra (Faculty of Chemistry, University of Warsaw, 02-093 Warsaw, Poland) ,  Dobrowolski Jan Cz. (National Medicines Institute, 00-725 Warsaw, Poland) ,  Sadlej Joanna (National Medicines Institute, 00-725 Warsaw, Poland) ,  Sadlej Joanna (Faculty of Mathematics and Natural Sciences, University of Cardinal Stefan Wyszynski, 1/3 Woycickiego-Str., 01-938 Warsaw, Poland)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 24  号： 4  ページ： 740  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 21のフェンタニル誘導体とオピオイド受容体(OR)との相互作用を,実験的および理論的方法を用いて研究した。ORへのそれらの結合を放射性リガンド競合結合アッセイで評価した。結合親和性データの均一なセットは,2つの新しい及び1つの以前に特性化されていない誘導体の値を含む。データはこれまで知られている傾向を確認し,それらの均一性により,それらは更なる比較を容易にする。実験的親和性を説明する構造的仮説を提供するために,研究した誘導体とORとの錯体をモデル化し,分子動力学シミュレーションを行った。これらのシミュレーションにより,5つの共通の一般的特徴(GFs)が得られた。それらは,GF1)D147と配位子ピペリジンNH+部分の間のイオン相互作用;GF2)OR内部へのN鎖配向;GF3)リガンドの他の極は受容体出口に向けられる;GF4)芳香族アニリド環はTM3,TM4,ECL1及びECL2により形成されたサブポケットを透過する;GF5)4軸置換基(もし存在すれば)はW318に向けられる。D147とのイオン相互作用を除いて,大部分のナフチル-OR接触は疎水性である。興味深いことに,結合親和性とN鎖および/またはアニリド芳香環の体積の間の非線形関係を見出すことができた。この種の関係はリガンド受容体結合に関与する相互作用の無極性と一致する。親和性は中サイズに対して最適に達し,一方,それは大及び小置換基に対して減少した。さらに,W293とW133の体積と平均二面角の間の線形相関を分子動力学研究により明らかにした。W293残基が活性化過程に関与するので,これは特に重要であると思われる。さらに,シミュレーションで見出されたY326(OH)とD147(C)距離も配位子サイズに依存した。対照的に,RMSF測度もD114/Y336水和も有意な構造に基づく相関を示さなかった。それらはまた,研究したフェンタニル誘導体を区別しなかった。最終的に,14の一般的なスコア関数のどれも,予測と観察された親和性データの間に有意な相関をもたらさなかった(R<0.30,n=28)。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 疎水性 ,  非極性 ,  キャラクタリゼーション ,  分子動力学 ,  計算機シミュレーション ,  *計算 ,  相互作用 ,  イオン ,  水和 ,  錯体 ,  モデリング ,  親和性 ,  測度 ,  脂肪酸 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族アミン ,  カルボアミド
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  結合親和性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： フェンタニル ,  オピオイド受容体 ,  分子動力学 ,  デザイナードラッグ

分類 (2件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

物質索引 (1件)： フェンタニル

引用文献 (92件)：

• Cortazzo, M.H.; Copenhaver, D.; Fishman, S.M. Major Opioids and Chronic Opioid Therapy. In Practical Management of Pain; Elsevier: Amsterdam, The Netherlands, 2014; pp. 495.e3-507.e3. ISBN 9780323083409.
• Stanley, T.H. The Fentanyl Story. J. Pain 2014, 15, 1215-1226.
• Vardanyan, R.S.; Hruby, V.J. Fentanyl-related compounds and derivatives: Current status and future prospects for pharmaceutical applications. Future Med. Chem. 2014, 6, 385-412.
• Burns, S.M.; Cunningham, C.W.; Mercer, S.L. DARK Classics in Chemical Neuroscience: Fentanyl. ACS Chem. Neurosci. 2018, 9, 2428-2437.
• Valdez, C.A.; Leif, R.N.; Mayer, B.P. An Efficient, Optimized Synthesis of Fentanyl and Related Analogs. PLoS ONE 2014, 9, e108250.

タイトルに関連する用語 (6件)： ミューオピオイド受容体 ,  フェンタニル ,  ファミリー ,  計算 ,  解析 ,  評価