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J-GLOBAL ID:201902241940382154   整理番号:19A0454380

Trichopriaショウジョウバエ(膜翅類:Diapriidae)の発生トランスクリプトームとクチクラ蛋白質遺伝子への洞察【JST・京大機械翻訳】

The developmental transcriptome of Trichopria drosophilae (Hymenoptera: Diapriidae) and insights into cuticular protein genes
著者 (21件):
資料名:
巻: 29  ページ: 245-254  発行年: 2019年 
JST資料番号: W2148A  ISSN: 1744-117X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: オランダ (NLD)  言語: 英語 (EN)
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蛹の内部寄生バチTrichopria drosophorae(膜翅目:Diapriidae)は,良く知られた侵入性害虫であるDrosophila suzuiiを含む多くの果実ハエ種の生物学的防除において重要な役割を果たしている。ここでは,異なる発生段階におけるT.drosphiaeのトランスクリプトームを報告する。全部で601,148,438の高品質リードを得て,1096bpの平均長さを有する187,704の単一遺伝子にde novo集合した。それらの間で,21,735の単一遺伝子を52の遺伝子オントロジー用語に注釈し,36,898をOrthorous群カテゴリーの25のクラスタに割り当てた。一方,30585の単一遺伝子をGenとGenomesの異なる経路の270の京都Encyclopediaにマップした。差次的に発現した遺伝子の数は,異なる発生段階間の比較を通して見出された。著者らはさらに,T.drosophilaeトランスクリプトームからの137クチクラ蛋白質遺伝子(CPs)を同定した。それらは,CPRファミリーからの59,Tweedleファミリーからの2,CPFファミリーからの1,CPAPファミリーからの46,および他のCPファミリーからの29であった。著者らは,T.drosophilaeの異なる発生段階におけるCPsの発現パターンを分析し,いくつかの段階特異的CPsを見出した。定量的リアルタイムPCR結果は,8つのランダムに選択されたCPsの相対的発現レベルに基づくRNA配列決定所見を確認した。本研究は,T.drosophilaeの発生と生理学の包括的理解のための価値あるトランスクリプトーム資源を提供し,生物学的防除目的に対するそれらの寄生効率を改善するのに役立つであろう。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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遺伝子発現 

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