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J-GLOBAL ID：201902242013334496   整理番号：19A1280511

本質的に無秩序な領域と構造ドメインは免疫関連哺乳類蛋白質において急速に進化する【JST・京大機械翻訳】

Both Intrinsically Disordered Regions and Structural Domains Evolve Rapidly in Immune-Related Mammalian Proteins

著者 (4件)： Homma Keiichi (Department of Life Science and Informatics, Maebashi Institute of Technology, 460-1 Kamisadori-machi, Maebashi-shi 371-0816, Japan) ,  Anbo Hiroto (Department of Life Science and Informatics, Maebashi Institute of Technology, 460-1 Kamisadori-machi, Maebashi-shi 371-0816, Japan) ,  Noguchi Tamotsu (Pharmaceutical Education Research Center, Meiji Pharmaceutical University, 2-522-1 Noshio, Kiyose-shi, Tokyo 204-8588, Japan) ,  Fukuchi Satoshi (Department of Life Science and Informatics, Maebashi Institute of Technology, 460-1 Kamisadori-machi, Maebashi-shi 371-0816, Japan)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 19  号： 12  ページ： 3860  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 真核生物蛋白質は構造ドメイン(SDs)と本質的に不規則な領域(IDRs)から成る。すなわち,それら自身による領域はユニークな三次元構造を仮定しない。IDRは一般的により少ない制約を受け,SDsより急速に進化する。蛋白質対蛋白質相互作用(PPIs)のより低い数を持つ蛋白質も,より少なく制約され,急速に進化する傾向がある。哺乳類,特に免疫関連細胞外蛋白質の細胞外蛋白質は,平均的に比較的高い進化速度を有する。本論文は,IDRsにおける高い進化率,または,SDsにおけるそれが細胞外蛋白質の急速な進化を説明するかどうかを調べることを目的とした。この目的のために,細胞の局在化に基づいて真核生物蛋白質を分類し,それらを分析した。さらに,蛋白質をSDsとIDRsに分割し,それぞれの進化速度を計算した。分数IDR含有量は進化速度と正の相関を示した。それらの分数IDR含量に対して,免疫関連細胞外蛋白質は異常に高い進化速度を示す。IDRはほとんどの細胞内局在化においてSDsより急速に進化する。しかしながら,細胞外蛋白質において,差異は減少する。哺乳類における免疫関連蛋白質については,SDsにおける進化率はIDRにおけるそれらに近い。このように,IDRとSDsの両方における高い進化速度は,免疫関連蛋白質の急速な進化を説明する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *高速度 ,  *タンパク質 ,  *哺乳類 ,  真核生物
準シソーラス用語： 細胞内局在 ,  局在化 ,  進化速度 ,  細胞外蛋白質 ,  蛋白質間相互作用 ,  三次元構造 ,  *ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 分泌 ,  免疫 ,  細胞外 ,  蛋白質-蛋白質相互作用 ,  本質的に無秩序な領域 ,  構造領域 ,  進化

分類 (1件)： 細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (43件)：

• Wright, P.E.; Dyson, H.J. Intrinsically unstructured proteins: Re-assessing the protein structure-function paradigm. J. Mol. Biol. 1999, 293, 321-331.
• Brown, C.J.; Takayama, S.; Campen, A.M.; Vise, P.; Marshall, T.W.; Oldfield, C.J.; Williams, C.J.; Dunker, A.K. Evolutionary rate heterogeneity in proteins with long disordered regions. J. Mol. Evol. 2002, 55, 104-110.
• Fraser, H.B.; Hirsh, A.E.; Steinmetz, L.M.; Scharfe, C.; Feldman, M.W. Evolutionary rate in the protein interaction network. Science 2002, 296, 750-752.
• Krylov, D.M.; Wolf, Y.I.; Rogozin, I.B.; Koonin, E.V. Gene loss, protein sequence divergence, gene dispensability, expression level, and interactivity are correlated in eukaryotic evolution. Genome Res. 2003, 13, 2229-2235.
• Pál, C.; Papp, B.; Hurst, L.D. Highly expressed genes in yeast evolve slowly. Genetics 2001, 158, 927-931.

タイトルに関連する用語 (5件)： ドメイン ,  免疫 ,  哺乳類 ,  蛋白質 ,  進化