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J-GLOBAL ID：201902242023990017   整理番号：19A0660118

ドデシル硫酸ナトリウムの全原子ポテンシャルモデルの開発と検証【JST・京大機械翻訳】

Developing and Validating a Set of All-Atom Potential Models for Sodium Dodecyl Sulfate

著者 (2件)： Farafonov Vladimir S. (Department of Physical Chemistry, V.N. Karazin Kharkiv National University, Ukraine) ,  Lebed Alexander V. (Department of Physical Chemistry, V.N. Karazin Kharkiv National University, Ukraine)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 6  ページ： 2742-2750  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 広く使われているOPLS-AAと一般的なAMBER力場の枠内で開発されたドデシル硫酸ナトリウム(SDS)の新しい全原子ポテンシャルモデルのセットを示した。モデルに対するパラメータの選択は,他の化合物に対するモデルとの完全な適合性を保証するために使用された力場の方法論に従って厳密に行われる。GAFFモデルに対して,信頼できるBoltzmann平均原子点電荷を得るために広範な量子化学計算を行い,後者を単一配座電荷と比較した。炭化水素尾部の表現のために,脂質と長いアルカンの性質を正確に再現する最近発表された改良パラメータを用いた。モデルはSDS単量体の拡散係数と同様にミセルの主な性質(サイズ,対イオン結合の程度)の正しい再現に基づいて検証された。拡張試験として,高い凝集数(382)と非自然な初期形状を持つミセルのシミュレーションを行い,正しい形状への再構成を観察した。これは,大きなミセルを含む濃縮SDS溶液のシミュレーションに対する開発したモデルの適合性を証明し,また,ミセル特性に対する炭化水素テールパラメータの重要性を強調した。最後に,開発したDS-モデルをいくつかの一般的なNa+および水モデルと組み合わせて試験した。SDSミセルの特性に及ぼすそれらの影響を考察し,適切な組合せを決定した。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルカン ,  ミセル ,  *モデル ,  拡散係数 ,  脂質 ,  適応性 ,  対イオン ,  立体配座 ,  水モデル ,  単量体 ,  力の場 ,  電荷 ,  再構成 ,  脂肪族アルコール ,  無機酸エステル
準シソーラス用語： AMBER , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  ミセル  (CB11020N) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H)

物質索引 (1件)： ドデシル硫酸ナトリウム

タイトルに関連する用語 (5件)： ドデシル硫酸ナトリウム ,  原子 ,  ポテンシャルモデル ,  開発 ,  検証