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J-GLOBAL ID：201902242207194128   整理番号：19A0713226

多遺伝子座核DNAのバーコードはナイジェリアにおけるプレおよびポストアルテメテル/ルメファントリン処理Plasmodium falciparumにおける遺伝的関連性を同定する【JST・京大機械翻訳】

A barcode of multilocus nuclear DNA identifies genetic relatedness in pre- and post-Artemether/Lumefantrine treated Plasmodium falciparum in Nigeria

著者 (12件)： Oyebola Kolapo Muyiwa (Medical Research Council Unit of The London School of Hygiene and Tropical Medicine, Bakau, The Gambia) ,  Oyebola Kolapo Muyiwa (Parasitology and Bioinformatics, Department of Zoology, Faculty of Science, University of Lagos, Lagos, Nigeria) ,  Oyebola Kolapo Muyiwa (West African Centre for Cell Biology of Infectious Pathogens, College of Basic and Applied Sciences, University of Ghana, Legon, Ghana) ,  Aina Oluwagbemiga Olanrewaju (Malaria Research Group, Nigerian Institute of Medical Research, Lagos, Nigeria) ,  Idowu Emmanuel Taiwo (Parasitology and Bioinformatics, Department of Zoology, Faculty of Science, University of Lagos, Lagos, Nigeria) ,  Olukosi Yetunde Adeola (Parasitology and Bioinformatics, Department of Zoology, Faculty of Science, University of Lagos, Lagos, Nigeria) ,  Olukosi Yetunde Adeola (Malaria Research Group, Nigerian Institute of Medical Research, Lagos, Nigeria) ,  Ajibaye Olusola Sunday (Malaria Research Group, Nigerian Institute of Medical Research, Lagos, Nigeria) ,  Otubanjo Olubunmi Adetoro (Parasitology and Bioinformatics, Department of Zoology, Faculty of Science, University of Lagos, Lagos, Nigeria) ,  Awolola Taiwo Samson (Malaria Research Group, Nigerian Institute of Medical Research, Lagos, Nigeria) ,  Awandare Gordon Akanzuwine (West African Centre for Cell Biology of Infectious Pathogens, College of Basic and Applied Sciences, University of Ghana, Legon, Ghana) ,  Amambua-Ngwa Alfred (Medical Research Council Unit of The London School of Hygiene and Tropical Medicine, Bakau, The Gambia)
資料名： BMC Infectious Diseases (Web)  (BMC Infectious Diseases (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 392  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7430A  ISSN： 1471-2334  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： いくつかの流行地域におけるアルテミシニンに基づく組合せ処理(ACT)の有効性の低下は,マラリアの世界的な除去への進展を脅かす。マラリア流行地域における薬物耐性の分子監視は,突然変異株の出現と伝播を検出するために重要である。著者らは,Lagos(ナイジェリア)における複雑でないマラリア原虫感染症の治療のためのアルテメテル-ルメファントリンの有効性に対する89人のマラリア患者を観察し,集団における薬剤耐性株の罹患率を測定した。処理開始後0,1,3,7,14,21および28日目に試料を有する65人の患者について,寄生虫クリアランス率を顕微鏡および高感度var遺伝子酸性末端配列(varATS)ポリメラーゼ連鎖反応により測定した。前処理および後処理試料からの寄生虫DNAのゲノムフィンガープリントを,P.falciparumに対する24個の核一塩基多型(SNP)バーコードを用いて決定した。クロロキン耐性輸送体遺伝子(crt-76),多剤耐性遺伝子(mdr1-86およびmdr1-184),ジヒドロプテロートシンターゼ(dhps-540),ジヒドロ葉酸レダクターゼ(dhfr-108)およびケルチドメイン(K-13580)における薬剤耐性関連対立遺伝子を,ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)フラグメントの高分解能融解分析により遺伝子型決定した。varATS qPCRにより,参加者の12名(18.5%)は治療後3日目に血液中に検出可能な寄生虫DNAを有していたが,8名(12.3%)の個人は遺伝子型28日の寄生虫血症を示した。感染の複雑性(CoI)は0日目で1.30日目,28日目で1.34日目であり,すべてのバーコードにわたる平均期待ヘテロ接合性(HE)値は0日目と28日目にそれぞれ0.50±0.05と0.56±0.05であった。バーコード(π)対比較は,再出現感染を示した8人のうち3人(37.5%)において,0日目と28日目の寄生虫分離株の高い遺伝的関連性を示した。Crt-76変異体対立遺伝子は38(58.5%)分離株に存在した。mdr1-86突然変異体対立遺伝子は,56(86.2%)分離株で見つかった。K-13580の突然変異は観察されなかった。治療後の症例の18%以上におけるDNA検出可能な寄生虫血症の持続性および前処理と後処理感染の間の遺伝的関連性の兆候は,ナイジェリアにおけるACT有効性の減少の徴候に対するより大きな集団のさらなる研究を保証する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： マラリア ,  *バーコード ,  有効性 ,  寄生虫 ,  前処理 ,  *ナイジェリア連邦共和国 ,  突然変異 ,  *DNA【核酸】 ,  薬物耐性 ,  症例報告 ,  治療法 ,  対立遺伝子 ,  定量的PCR法 ,  一塩基多型 ,  遺伝子型
準シソーラス用語： 分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アルテミシニンに基づく組合せ ,  薬剤耐性 ,  寄生虫クリアランス ,  SNPバーコード ,  残存寄生虫症 ,  遺伝的関連性

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  感染症・寄生虫症の治療  (GD01030D)

引用文献 (26件)：

• WHO, 2016: Summary. Geneva: World Health Organization; 2017 (WHO/HTM/GMP/2017.4).
• Adjuik M, Babiker A, Garner P, Olliaro P, Taylor W, White N et al. Artesunate combinations for treatment of malaria: meta-analysis. Lancet. 2004; 3:363(9402):9-17.
• N Engl J Med; Tracking resistance to artemisinin collaboration (TRAC). Spread of artemisinin resistance in Plasmodium falciparum malaria; EA Ashley, M Dhorda, RM Fairhurst, C Amaratunga, P Lim, S Suon; 371; 2014; 411-423; 10.1056/NEJMoa1314981; citation_id=CR3
• N. Engl J Med; Emergence of indigenous artemisinin-resistant Plasmodium falciparum in Africa; F Lu, R Culleton, M Zhang, A Ramaprasad, L von Seidlein, Zhou; 376; 10; 2017; 991-993; 10.1056/NEJMc1612765; citation_id=CR4
• PLoS One; Therapeutic efficacy of artemether-lumefantrine against uncomplicated Plasmodium falciparum malaria in a high-transmission area in Northwest Ethiopia; M Teklemariam, A Assefa, M Kassa, H Mohammed, H Mamo; 12; 4; 2017; 10.1371/journal.pone.0176004; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： 遺伝子座 ,  核DNA ,  バーコード ,  ナイジェリア ,  アルテメテル ,  ルメファントリン ,  Plasmodium ,  遺伝的関連性 ,  同定