高スループットmRNAシークエンシングは実験的中大脳動脈閉塞におけるTao-Hong-Si-Wu煎剤の潜在的治療標的を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Duan Xianchun; Duan Xianchun; Duan Xianchun; Han Lan; Han Lan; Peng Daiyin; Peng Daiyin; Chen Weidong; Chen Weidong; Peng Can; Peng Can; Xiao Ling; Bao Qiuyu

文献

J-GLOBAL ID：201902243286258624 整理番号：19A1588558

高スループットmRNAシークエンシングは実験的中大脳動脈閉塞におけるTao-Hong-Si-Wu煎剤の潜在的治療標的を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

High Throughput mRNA Sequencing Reveals Potential Therapeutic Targets of Tao-Hong-Si-Wu Decoction in Experimental Middle Cerebral Artery Occlusion

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資料名：
巻： 9 ページ： 1570 発行年： 2018年
JST資料番号： U7091A ISSN： 1663-9812 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

背景:実験的および臨床的研究により,Tao-Hong-Si-Wu煎剤(THSWD)は,中脳動脈閉塞症(MCAO)に起因する神経学的欠損を改善することが示されている。しかし,MCAOにおけるTHSWDの作用機序は特性化されていない。本研究では,mRNAトランスクリプトームを用いて,THSWDの種々の治療標的を研究した。【方法】RNA-seqを用いて,差別的に発現した遺伝子(DEG)を同定した。MCAO誘導アップレギュレーション遺伝子(MCAO対対照)およびTHSWD誘導ダウンレギュレーション遺伝子(MCAOと比較して)を同定した。交差遺伝子は,THSWDによって逆転されたMCAO誘導遺伝子発現として同定された上方制御された差次的発現遺伝子(上方DEG)として定義された。MCAOによりダウンレギュレーションされ,THSWDによりアップレギュレーションされた遺伝子は,別の一連の交差点としてグループ化された。生物学的機能とシグナル伝達経路は,遺伝子オントロジー(GO)と遺伝子とゲノム(KEGG)経路分析の京都encycloによって決定された。さらに,いくつかの同定された遺伝子をRT-qPCRによって検証した。【結果】合計339のDEGを,2つのシリーズ(MCAO対対照およびMCAO対THSWD)に基づいて濾過し,細胞周期(rno04110),ECM受容体相互作用(rno04510),神経活性リガンド受容体相互作用(rno05031),神経活性リガンド-受容体相互作用(rno05033),脂肪消化および吸収(rno04975),グリセロリン脂質代謝(rno00564),その他を示した。蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークは,202のノードと1,700の接続から成り,MOCDEによって2つの主要モジュールを同定した。【結論】細胞周期(rno04110),ECM受容体相互作用(rno04510),造血細胞系譜(rno04640),および神経活性リガンド受容体相互作用(rno04080)は,MCAOにおけるTHSWDの潜在的治療標的である。本研究は,脳内出血に起因する神経障害のTHSWD予防のための理論的基礎を提供した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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消化器の腫よう , 遺伝子発現 , 腫ようの化学・生化学・病理学

引用文献 (31件)：

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