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J-GLOBAL ID：201902243553382760   整理番号：19A1407959

生体分子への結合における振動エントロピー変化の剛性理論に基づく近似【JST・京大機械翻訳】

Rigidity Theory-Based Approximation of Vibrational Entropy Changes upon Binding to Biomolecules

著者 (5件)： Gohlke Holger (Institute for Pharmaceutical and Medicinal Chemistry, Department of Mathematics and Natural Sciences, Heinrich Heine University Duesseldorf, Germany) ,  Ben-Shalom Ido Y. (Institute for Pharmaceutical and Medicinal Chemistry, Department of Mathematics and Natural Sciences, Heinrich Heine University Duesseldorf, Germany) ,  Kopitz Hannes (Institute for Pharmaceutical and Medicinal Chemistry, Department of Mathematics and Natural Sciences, Heinrich Heine University Duesseldorf, Germany) ,  Pfeiffer-Marek Stefania (R&D/Pre-Development Sciences, Sanofi-Aventis Deutschland GmbH, Germany) ,  Baringhaus Karl-Heinz (R&D Resources/Site Direction, Sanofi-Aventis Deutschland GmbH, Germany)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 4  ページ： 1495-1502  発行年： 2017年04月 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 剛性理論に基づく生体分子への結合による振動エントロピー変化(ΔS_vib)の計算的に効率的な近似を導入した。結合パートナーの制約ネットワーク表現から,ΔS_vibは,ネットワークの協調数の変化に関して,低周波数(「海綿」)モードの数の変化から推定される。正常モード解析(NMA)によって計算したΔS_vibと比較して,著者らの方法は,蛋白質-蛋白質および蛋白質-配位子複合体のデータセットに対して,有意で良好な相関をもたらした。著者らのアプローチは,エンドポイント(自由)エネルギー法におけるNMAベースのΔS_vib計算に対する価値ある代替案となり得る。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 複合体 ,  ネットワーク ,  タンパク質 ,  海綿動物 ,  エネルギー法 ,  *近似法 ,  *剛性 ,  基準モード ,  LF【周波数】
準シソーラス用語： エンドポイント ,  *振動エントロピー ,  *生体分子 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (5件)： 分子の電子構造  (BH05010Q) ,  分子構造  (EB03020Y) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  反応速度論・触媒一般  (CB06010G) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： 生体分子 ,  振動エントロピー ,  剛性 ,  理論 ,  近似